23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2236 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2236  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 73 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785928  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2716  hypothetical protein  69.86 
 
 		 73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1293  hypothetical protein  61.64 
 
 		 73 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.598885  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  55.56 
 
 		 75 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  55.71 
 
 		 75 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4318  protein of unknown function UPF0150  59.09 
 
 		 51 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  53.33 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0670  hypothetical protein  51.11 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.078496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5957  hypothetical protein  51.11 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0249  hypothetical protein  54.35 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  31.08 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  32.43 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  32.43 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1747  hypothetical protein  42.55 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19825  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4651  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000711618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0851  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0878  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336866  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  41.86 
 
 		 70 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  45.65 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1351  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0852  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1097  hypothetical protein  39.13 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>