22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5957 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5957  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  158  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0670  hypothetical protein  98.72 
 
 		 88 aa  154  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.078496 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0249  hypothetical protein  61.19 
 
 		 71 aa  90.1  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  44.07 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1097  hypothetical protein  46.03 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448114  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2716  hypothetical protein  53.33 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  46 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3012  hypothetical protein  51.11 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2236  protein of unknown function UPF0150  51.11 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785928  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1293  hypothetical protein  53.33 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.598885  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0904  hypothetical protein  44.9 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.706958  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  41.94 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0871  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302408  normal  0.0367902 
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_1351  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  48.89 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1229  protein of unknown function UPF0150  54.72 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1703  hypothetical protein  38.46 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4651  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000711618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1747  hypothetical protein  36.73 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19825  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3222  hypothetical protein  34.48 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.151978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>