37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0153 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  143  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1097  hypothetical protein  68.57 
 
 
70 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448114  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0871  hypothetical protein  58.73 
 
 
74 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302408  normal  0.0367902 
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_1351  protein of unknown function UPF0150  63.08 
 
 
70 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4651  protein of unknown function UPF0150  57.14 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000711618 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  50.79 
 
 
85 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  50.75 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1293  hypothetical protein  60.47 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.598885  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  53.19 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4008  hypothetical protein  56.41 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0249  hypothetical protein  46.03 
 
 
71 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0811  hypothetical protein  55.32 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00560796  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0670  hypothetical protein  41.94 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.078496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  47.73 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2716  hypothetical protein  46.51 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287046  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5957  hypothetical protein  41.94 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1229  protein of unknown function UPF0150  49.25 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  55.26 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  55.26 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  44 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4318  protein of unknown function UPF0150  46.34 
 
 
51 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  51.06 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  51.06 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  43.48 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  47.83 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2236  protein of unknown function UPF0150  41.86 
 
 
73 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  45.45 
 
 
76 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3012  hypothetical protein  37.5 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4378  protein of unknown function UPF0150  32.76 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000452582  unclonable  0.00000000142401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4316  protein of unknown function UPF0150  32.76 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  39.29 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  39.29 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  54.29 
 
 
55 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  38.46 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  40.74 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  47.83 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  47.83 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>