15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3012 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3012  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  143  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0670  hypothetical protein  53.33 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.078496 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0249  hypothetical protein  54.05 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5957  hypothetical protein  51.11 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  43.48 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  45.1 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1747  hypothetical protein  42.31 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19825  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2716  hypothetical protein  44.68 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1097  hypothetical protein  47.5 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  44.68 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1293  hypothetical protein  54.05 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.598885  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1703  hypothetical protein  36.36 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0852  hypothetical protein  41.46 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>