16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0547 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0547  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  170  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000844189  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2368  hypothetical protein  68.66 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00633601  normal  0.0946995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1506  hypothetical protein  60.29 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0732212  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2720  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000297468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3396  hypothetical protein  38.03 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0768  hypothetical protein  47.62 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0520  hypothetical protein  49.12 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.253253  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2822  protein of unknown function UPF0150  34.25 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.294877 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0167  hypothetical protein  38.81 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  36.92 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  37.04 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2702  hypothetical protein  38.03 
 
 		 364 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.805168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  30 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>