54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2214 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  228  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  57.01 
 
 		 110 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  56.07 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  52.43 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  53.4 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  47.57 
 
 		 109 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  45.63 
 
 		 116 aa  103  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  43.81 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  41.51 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  41.12 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  41.51 
 
 		 117 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  42.72 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  40.59 
 
 		 110 aa  94.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  39.62 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  41.18 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  40.38 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  38.68 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  41.18 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  38.32 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  41.58 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  40 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  37.86 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  39.81 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  39.22 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  34.58 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  34.95 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  35.85 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  42.57 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  34.31 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  32.71 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  38.54 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  38.54 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  42.86 
 
 		 77 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  42.86 
 
 		 77 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  44.16 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  33.65 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  44.78 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  40 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  32.65 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  33.82 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  33.82 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  33.82 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  33.82 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  26.47 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  55.56 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  55.56 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  25.51 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  42.86 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  25.93 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  43.48 
 
 		 118 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  41.86 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  47.5 
 
 		 109 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  42.5 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  35.21 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>