47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3197 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3197  HicB  100 
 
 		 106 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  51.43 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  46.23 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  47.62 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  43.4 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  48.11 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  42.45 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  43.81 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  40.82 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  40.82 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  41.51 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  40.57 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  40.57 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  38.1 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  38.46 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  39.62 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  38.46 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  38.78 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  38.68 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  33.02 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  38.68 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  33.96 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  42.5 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  44.29 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  36.84 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  35.71 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  33.68 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  46.27 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  29.52 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  32.63 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  28.57 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  31.63 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  35.06 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  35.06 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  34.69 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  30.39 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  27.18 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  28.57 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  38.33 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  32.63 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  32.63 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  30.43 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  30.43 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  30.43 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  30.43 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  29.81 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>