50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3189 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  100 
 
 		 117 aa  241  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  99.15 
 
 		 117 aa  239  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  47.75 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  45.87 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  50 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  45.45 
 
 		 116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  44.74 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  42.48 
 
 		 113 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  41.51 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  42.57 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  39.25 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  38.83 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  39.42 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  39.42 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  36.45 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  39.25 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  38.46 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  38.46 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  38.83 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  38.1 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  36.11 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  38.1 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  37.14 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  42.31 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  35.85 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  36.19 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  38.32 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  39.24 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  44.44 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  32.38 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  28.44 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  40.28 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  40.28 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  40.28 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  40.28 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  34.95 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  34.29 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  40.3 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  40.3 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  37.14 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  31.48 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  37.88 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  31.48 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  28.97 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  30.21 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  28.57 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  29.52 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0256  HicB family protein  22.22 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0262  HicB family protein  22.22 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  34.92 
 
 		 122 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>