42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1678 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1678  HicB  100 
 
 		 113 aa  236  9e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  75.22 
 
 		 113 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  75.23 
 
 		 110 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  71.43 
 
 		 113 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  49.06 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  50 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  47.75 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  46.85 
 
 		 117 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  46.43 
 
 		 116 aa  114  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  42.57 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  40.95 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  43.14 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  38.46 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  36.63 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  39.81 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  34.95 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  39.22 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  38.24 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  47.22 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  47.22 
 
 		 74 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  47.22 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  47.22 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  35.29 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  35.29 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  40.51 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  31.13 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  36.27 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  35.24 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  34.31 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  38.78 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  38.78 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  36.27 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  36.84 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  42.42 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  42.42 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  35.29 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  40.62 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  42.65 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  29.91 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  20.37 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0262  HicB family protein  24.56 
 
 		 118 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>