47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0180 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0180  HicB  100 
 
 		 111 aa  230  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  63.55 
 
 		 110 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  50 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  50.91 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  41.82 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  42.59 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  40.91 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  44.86 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  42.73 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  43.52 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  41.12 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  40.38 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  40.38 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  40 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  39.05 
 
 		 110 aa  94.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  46.99 
 
 		 83 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  43.52 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  38.68 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  42.57 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  36.27 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  34.95 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  34.29 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  29.63 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  31.43 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  43.42 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  43.42 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  34.91 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  34.29 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  33.01 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  33.02 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  46.27 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  34.95 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  34.95 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  45.59 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  27.52 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  29.73 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  31.82 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  38.57 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  38.57 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  38.57 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  38.57 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  30.99 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  29.91 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  27.52 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  27.52 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  26 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  41.67 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>