171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4080 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4080  Citrate lyase beta subunit-like protein  100 
 
 		 190 aa  397  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  65.75 
 
 		 293 aa  193  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  34.4 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  37.65 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  60.87 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  52.94 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  60.87 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  34.68 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  28.14 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  28.95 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  57.78 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  29.41 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  49.09 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  41.82 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  32.69 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  32.68 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  37.65 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  35.29 
 
 		 279 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  56.82 
 
 		 279 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  52.17 
 
 		 270 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  30.07 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  54.35 
 
 		 320 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  35.29 
 
 		 278 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  25 
 
 		 275 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  30.07 
 
 		 306 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  40.98 
 
 		 282 aa  52.4  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  29.37 
 
 		 306 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  29.37 
 
 		 307 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  55.81 
 
 		 274 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  32.14 
 
 		 292 aa  51.6  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  37.31 
 
 		 276 aa  51.2  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  26.95 
 
 		 304 aa  51.2  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  35.05 
 
 		 288 aa  51.2  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  30.14 
 
 		 289 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  31.58 
 
 		 288 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  61.54 
 
 		 267 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  61.54 
 
 		 267 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  28.12 
 
 		 289 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 		 308 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  55.26 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  26.43 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 289 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  27.46 
 
 		 274 aa  49.3  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  51.06 
 
 		 325 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  27.46 
 
 		 274 aa  49.3  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  48.94 
 
 		 325 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  29.58 
 
 		 271 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  28.77 
 
 		 316 aa  48.9  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  40 
 
 		 297 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  25.93 
 
 		 292 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  40.62 
 
 		 324 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  27.63 
 
 		 294 aa  48.5  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  30.07 
 
 		 310 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  30.07 
 
 		 310 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  51.06 
 
 		 327 aa  48.5  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  30.07 
 
 		 310 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  46.81 
 
 		 290 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  46.81 
 
 		 323 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  32.26 
 
 		 294 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2184  HpcH/HpaI aldolase  36.36 
 
 		 286 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00433365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  29.37 
 
 		 281 aa  48.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1878  HpcH/HpaI aldolase  51.16 
 
 		 279 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.820651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  47.83 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  34.07 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  40.62 
 
 		 324 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  31.25 
 
 		 274 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  32.26 
 
 		 294 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  32.18 
 
 		 289 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  40.62 
 
 		 324 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  40.62 
 
 		 324 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  48.89 
 
 		 277 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  42.55 
 
 		 296 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  53.33 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  31.48 
 
 		 281 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  27.27 
 
 		 301 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  39.06 
 
 		 323 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  27.14 
 
 		 294 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  47.62 
 
 		 282 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  28.8 
 
 		 292 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  29.58 
 
 		 276 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0924  citrate lyase  43.4 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  44 
 
 		 289 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1005  citrate lyase  43.4 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0985  citrate lyase  41.82 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  43.48 
 
 		 269 aa  45.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.11 
 
 		 289 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.11 
 
 		 289 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  35.11 
 
 		 289 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  47.62 
 
 		 282 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  47.62 
 
 		 283 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.11 
 
 		 289 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  35.11 
 
 		 289 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7288  citrate lyase  40.82 
 
 		 295 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  36.21 
 
 		 291 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  38.18 
 
 		 282 aa  45.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  52.38 
 
 		 304 aa  45.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  26.43 
 
 		 297 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  26.21 
 
 		 303 aa  45.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  30.59 
 
 		 296 aa  44.7  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  28.24 
 
 		 290 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>