249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0924 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1005  citrate lyase  100 
 
 		 171 aa  357  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0924  citrate lyase  100 
 
 		 171 aa  357  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0985  citrate lyase  99.42 
 
 		 171 aa  357  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0956  hypothetical protein  99.42 
 
 		 171 aa  356  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.614629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  36.45 
 
 		 293 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  40.37 
 
 		 274 aa  90.5  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  40.37 
 
 		 274 aa  90.5  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  38.46 
 
 		 270 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  38.39 
 
 		 266 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  34.21 
 
 		 279 aa  88.6  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  36.44 
 
 		 270 aa  87.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  33.62 
 
 		 276 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  36.52 
 
 		 274 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  36.54 
 
 		 270 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  37.39 
 
 		 275 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  33.91 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  33.04 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  39.42 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  37.39 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  37.39 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  31.9 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  33.9 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  33.91 
 
 		 297 aa  78.2  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  35.24 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  37.38 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  37.61 
 
 		 273 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  31.3 
 
 		 275 aa  74.7  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  31.62 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  32.43 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  34.82 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  32.38 
 
 		 274 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  33.93 
 
 		 294 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 290 aa  71.2  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 289 aa  70.9  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  30.09 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  36.63 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  35.65 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  28.17 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  31.53 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  30 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  29.25 
 
 		 288 aa  67.4  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  26.67 
 
 		 347 aa  67  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  38.24 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  37.97 
 
 		 268 aa  63.9  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  31.48 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  30.84 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  30.77 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  33.08 
 
 		 331 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1721  Citryl-CoA lyase  34.21 
 
 		 304 aa  62  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  26.32 
 
 		 271 aa  62  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  30 
 
 		 275 aa  61.2  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1878  HpcH/HpaI aldolase  50.98 
 
 		 279 aa  61.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.820651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  31.54 
 
 		 291 aa  61.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  33.68 
 
 		 304 aa  61.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  31.73 
 
 		 276 aa  60.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  31.9 
 
 		 276 aa  60.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  39.64 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  25.71 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  32.69 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03577  citrate lyase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13030)  36.76 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  28.41 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.23 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  33.82 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  27.59 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  29.91 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  33.82 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  34.33 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  33.82 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  38.75 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  46.67 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  31.03 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  30.63 
 
 		 296 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.63 
 
 		 282 aa  57.4  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  26.42 
 
 		 276 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  27.62 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  28.46 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  26.89 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  30.3 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758  putative citrate lyase beta chain (acyl lyase subunit)  32.58 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  28.83 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  55.1 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  30.33 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  30.4 
 
 		 302 aa  54.7  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  29.03 
 
 		 282 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  32.74 
 
 		 310 aa  54.3  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  32.41 
 
 		 284 aa  53.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  28.83 
 
 		 292 aa  53.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  25.66 
 
 		 281 aa  53.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  45 
 
 		 286 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3511  citrate (pro-3S)-lyase  33.02 
 
 		 292 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  57.89 
 
 		 278 aa  51.6  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  45.28 
 
 		 321 aa  51.2  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  27.52 
 
 		 295 aa  51.6  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  27.78 
 
 		 281 aa  51.2  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2184  HpcH/HpaI aldolase  46.94 
 
 		 286 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00433365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>