More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1275 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 
421 aa  877    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001062  vibrioferrin decarboxylase protein PvsE  57.64 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  54.96 
 
 
392 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3096  diaminopimelate decarboxylase  52.58 
 
 
394 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01927  diaminopimelate decarboxylase  48.97 
 
 
398 aa  368  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09300  diaminopimelate decarboxylase  50.52 
 
 
396 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000620759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.44 
 
 
408 aa  333  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0717  diaminopimelate decarboxylase  45.24 
 
 
402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0591874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.91 
 
 
402 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  40.61 
 
 
413 aa  315  8e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  41.61 
 
 
418 aa  309  6.999999999999999e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.31 
 
 
397 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.5 
 
 
400 aa  296  6e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.5 
 
 
400 aa  296  6e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.33 
 
 
405 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4867  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.79 
 
 
373 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.7 
 
 
388 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6954  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.38 
 
 
403 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.34 
 
 
362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.75 
 
 
392 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  32.73 
 
 
415 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4053  diaminopimelate decarboxylase  28.24 
 
 
484 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  31.12 
 
 
408 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.56 
 
 
411 aa  169  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  30.75 
 
 
402 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  30.61 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.2 
 
 
410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0663  diaminopimelate decarboxylase  29.44 
 
 
453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.31 
 
 
428 aa  166  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.79 
 
 
410 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.03 
 
 
412 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  30.89 
 
 
402 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.64 
 
 
419 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  29.77 
 
 
402 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.79 
 
 
431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.95 
 
 
404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.17 
 
 
414 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.02 
 
 
411 aa  150  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.1 
 
 
415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.72 
 
 
429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.37 
 
 
508 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  29.18 
 
 
407 aa  139  7e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.46 
 
 
442 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  27.03 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  27.3 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  28.84 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.14 
 
 
413 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.54 
 
 
430 aa  133  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.57 
 
 
408 aa  132  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  26.76 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.41 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  27.42 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.72 
 
 
404 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  27.27 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.9 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4492  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  29.43 
 
 
415 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.799972  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  27.08 
 
 
403 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.35 
 
 
409 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  27.18 
 
 
399 aa  126  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.75 
 
 
416 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.69 
 
 
440 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.89 
 
 
417 aa  123  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  26.7 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  26.85 
 
 
419 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  26.85 
 
 
419 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2472  diaminopimelate decarboxylase  24.6 
 
 
412 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.255967  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  28 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  27.19 
 
 
421 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  27.84 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1199  diaminopimelate decarboxylase  28.1 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0292186  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  30.59 
 
 
443 aa  117  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  27.44 
 
 
414 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  27.44 
 
 
414 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17190  diaminopimelate decarboxylase  24.1 
 
 
395 aa  116  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  27.44 
 
 
414 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2183  Diaminopimelate decarboxylase  27.3 
 
 
412 aa  116  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  26.44 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  25.76 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  24.54 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  26.67 
 
 
414 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  27.55 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  26.57 
 
 
416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_002950  PG2188  diaminopimelate decarboxylase  26.42 
 
 
382 aa  113  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  27.84 
 
 
421 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  25.45 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  27.61 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  25.99 
 
 
420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  28.61 
 
 
443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  26.61 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  23.95 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  26.23 
 
 
417 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2332  diaminopimelate decarboxylase  26.76 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.247782  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  25.34 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  26.15 
 
 
427 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.45 
 
 
416 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  26.1 
 
 
434 aa  109  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3583  diaminopimelate decarboxylase  27.03 
 
 
414 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  25.88 
 
 
427 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  27.61 
 
 
414 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.024639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0203  diaminopimelate decarboxylase  26.84 
 
 
419 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.628049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>