More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1392 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  100 
 
 
415 aa  816    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  73.15 
 
 
412 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  71.01 
 
 
414 aa  569  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  63.73 
 
 
410 aa  518  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  63.04 
 
 
410 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  63.79 
 
 
411 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  62.75 
 
 
416 aa  501  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  60.15 
 
 
404 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  58.45 
 
 
411 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  60.25 
 
 
408 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  56.78 
 
 
402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  58.06 
 
 
402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  56.77 
 
 
402 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  53.02 
 
 
408 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  51.64 
 
 
413 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  55.33 
 
 
409 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  52.84 
 
 
404 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.73 
 
 
430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.11 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.36 
 
 
431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.22 
 
 
429 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.79 
 
 
419 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.42 
 
 
416 aa  273  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.99 
 
 
442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.56 
 
 
414 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.37 
 
 
417 aa  257  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.6 
 
 
440 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.56 
 
 
508 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.77 
 
 
415 aa  229  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.14 
 
 
388 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.88 
 
 
392 aa  202  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  36.72 
 
 
413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.73 
 
 
421 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.22 
 
 
397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.28 
 
 
428 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.12 
 
 
416 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.67 
 
 
400 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.67 
 
 
400 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.14 
 
 
418 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0717  diaminopimelate decarboxylase  36.9 
 
 
402 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0591874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3096  diaminopimelate decarboxylase  36.59 
 
 
394 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  34.38 
 
 
418 aa  176  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001062  vibrioferrin decarboxylase protein PvsE  30.84 
 
 
400 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.6 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.81 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.93 
 
 
402 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  35.16 
 
 
394 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  35.09 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  32.69 
 
 
429 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  34.15 
 
 
422 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09300  diaminopimelate decarboxylase  35.53 
 
 
396 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000620759  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4053  diaminopimelate decarboxylase  35.59 
 
 
484 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 
418 aa  159  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  34.06 
 
 
422 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01927  diaminopimelate decarboxylase  35.31 
 
 
398 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  32.72 
 
 
399 aa  157  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  32.72 
 
 
407 aa  157  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  35.43 
 
 
414 aa  156  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  32.35 
 
 
447 aa  156  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 
419 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 
419 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 
421 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  33.91 
 
 
421 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 
415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4867  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.95 
 
 
373 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4044  diaminopimelate decarboxylase  35.29 
 
 
422 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  29.95 
 
 
412 aa  151  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 
421 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  32.79 
 
 
429 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  32.93 
 
 
421 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6954  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.09 
 
 
403 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  34.69 
 
 
421 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  32.56 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  31.54 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  34.14 
 
 
414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  32.76 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  33.59 
 
 
421 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  32.61 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2332  diaminopimelate decarboxylase  29.07 
 
 
384 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.247782  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  27.78 
 
 
419 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 
422 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2675  diaminopimelate decarboxylase  32.92 
 
 
419 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  31.19 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4395  decarboxylase domain-containing protein  48.39 
 
 
171 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  33.16 
 
 
422 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2176  diaminopimelate decarboxylase  36.22 
 
 
430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.42 
 
 
362 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  30.79 
 
 
403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  32.91 
 
 
421 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  31.04 
 
 
445 aa  145  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  33.08 
 
 
421 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  30.51 
 
 
418 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  32.15 
 
 
402 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  32.34 
 
 
402 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  33.91 
 
 
425 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  32.41 
 
 
421 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  31.6 
 
 
419 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.66 
 
 
392 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5579  diaminopimelate decarboxylase  34.95 
 
 
451 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  32.69 
 
 
415 aa  144  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>