More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0486 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 417 aa  832    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  56.44 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.66 
 
 		 442 aa  332  6e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.28 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.55 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.61 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.33 
 
 		 429 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.36 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.97 
 
 		 419 aa  256  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  40.37 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  40.8 
 
 		 402 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  40.98 
 
 		 402 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.73 
 
 		 410 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.1 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  39.64 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.6 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.05 
 
 		 411 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.01 
 
 		 404 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.85 
 
 		 414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  38.83 
 
 		 416 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.75 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.93 
 
 		 414 aa  221  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.16 
 
 		 412 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  40.94 
 
 		 408 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1016  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  45.41 
 
 		 499 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.24 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  31.86 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.15 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.77 
 
 		 408 aa  193  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.27 
 
 		 430 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.23 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  30.31 
 
 		 412 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  31.02 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.04 
 
 		 418 aa  183  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  30.99 
 
 		 403 aa  183  6e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  31.02 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  32.04 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  34.79 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  30.66 
 
 		 403 aa  180  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  33.99 
 
 		 418 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  30.77 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.17 
 
 		 413 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  32.13 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  34.07 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  32.02 
 
 		 435 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  29.41 
 
 		 419 aa  176  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  30.1 
 
 		 399 aa  176  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  34.66 
 
 		 415 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  30.14 
 
 		 435 aa  176  9e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  30.62 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.73 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  29.73 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  31.7 
 
 		 416 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  34.07 
 
 		 415 aa  172  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  34.16 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  30.29 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  31.98 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  34.28 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.51 
 
 		 397 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  34.13 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0744  diaminopimelate decarboxylase  34.7 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 434 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  34.06 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  34.45 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  29.44 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  34.3 
 
 		 422 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1721  diaminopimelate decarboxylase  34.38 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  35.13 
 
 		 413 aa  167  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  32.45 
 
 		 414 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  30.02 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  33.82 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  33.82 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1473  diaminopimelate decarboxylase  29.81 
 
 		 436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  32.1 
 
 		 417 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0515  diaminopimelate decarboxylase  29.5 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.843079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  34.39 
 
 		 414 aa  166  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  32.51 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  33.65 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  30 
 
 		 445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  33.09 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  34.47 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  33.41 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  29.66 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  32.92 
 
 		 415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  30.14 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  31.58 
 
 		 414 aa  163  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  32.68 
 
 		 416 aa  163  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  29.93 
 
 		 418 aa  162  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2123  diaminopimelate decarboxylase  33.66 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0541  diaminopimelate decarboxylase  28.04 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.407931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  33.09 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  31.78 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>