More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2669 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 
410 aa  831    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  68.32 
 
 
410 aa  581  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  65.21 
 
 
411 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  63.48 
 
 
416 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  63.55 
 
 
412 aa  511  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  63.73 
 
 
415 aa  514  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  62.65 
 
 
414 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  59.05 
 
 
411 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  55.78 
 
 
404 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  59.15 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  55.5 
 
 
402 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  52.94 
 
 
402 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  52.67 
 
 
402 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  53.2 
 
 
409 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  50.12 
 
 
408 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.38 
 
 
413 aa  349  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  47.38 
 
 
404 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.51 
 
 
430 aa  314  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.18 
 
 
431 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.68 
 
 
428 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.76 
 
 
416 aa  288  9e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.16 
 
 
429 aa  286  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.34 
 
 
419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.59 
 
 
442 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.12 
 
 
440 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.6 
 
 
417 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.66 
 
 
414 aa  236  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.63 
 
 
415 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.4 
 
 
508 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.26 
 
 
418 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.72 
 
 
428 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.71 
 
 
388 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.25 
 
 
397 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.59 
 
 
405 aa  176  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  33.16 
 
 
413 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  32.45 
 
 
401 aa  170  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.23 
 
 
400 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.23 
 
 
400 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.92 
 
 
392 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3096  diaminopimelate decarboxylase  34.64 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.2 
 
 
421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.88 
 
 
416 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001062  vibrioferrin decarboxylase protein PvsE  30.26 
 
 
400 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  32.78 
 
 
427 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.77 
 
 
408 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  32.11 
 
 
422 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01927  diaminopimelate decarboxylase  33.78 
 
 
398 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  32.59 
 
 
427 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  32.54 
 
 
427 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  31.73 
 
 
422 aa  158  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4053  diaminopimelate decarboxylase  35.67 
 
 
484 aa  156  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  33.6 
 
 
394 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  30.95 
 
 
422 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  31.25 
 
 
418 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.26 
 
 
402 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  30.28 
 
 
421 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.13 
 
 
362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  28.86 
 
 
419 aa  153  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  31.39 
 
 
422 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  30.81 
 
 
425 aa  153  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0717  diaminopimelate decarboxylase  33.85 
 
 
402 aa  153  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0591874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  30.75 
 
 
418 aa  152  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  31.14 
 
 
422 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09300  diaminopimelate decarboxylase  33.52 
 
 
396 aa  150  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000620759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.05 
 
 
392 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  29.61 
 
 
429 aa  149  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4867  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.75 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155396  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  30.71 
 
 
416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  31.63 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  32.41 
 
 
414 aa  147  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  29.32 
 
 
403 aa  147  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  30.26 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  31.87 
 
 
419 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  31.87 
 
 
419 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  29.16 
 
 
421 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  28.82 
 
 
420 aa  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  29.67 
 
 
421 aa  143  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  31.13 
 
 
421 aa  143  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  32 
 
 
407 aa  143  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  30.45 
 
 
434 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  29.35 
 
 
402 aa  143  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  32.55 
 
 
422 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  29.16 
 
 
402 aa  143  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  29.9 
 
 
421 aa  142  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6954  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.62 
 
 
403 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160275  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  28.36 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  32.23 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  29.1 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  28.42 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  29.67 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  29.19 
 
 
435 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  30.37 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  30.65 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2332  diaminopimelate decarboxylase  29.64 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.247782  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  29.08 
 
 
402 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  30.75 
 
 
431 aa  140  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4044  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 
422 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  31.62 
 
 
416 aa  139  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  29.47 
 
 
412 aa  139  7e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  29.82 
 
 
416 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>