More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7006 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  100 
 
 
408 aa  798    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  59.15 
 
 
410 aa  488  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  60.25 
 
 
415 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  58.67 
 
 
416 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  57.91 
 
 
410 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  58.4 
 
 
411 aa  459  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  58.45 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  56.79 
 
 
412 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  53.92 
 
 
404 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  53.92 
 
 
402 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  55.03 
 
 
411 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  52.69 
 
 
402 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  52.85 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  55.22 
 
 
409 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  52.14 
 
 
408 aa  352  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  50.5 
 
 
404 aa  351  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.77 
 
 
413 aa  350  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.87 
 
 
430 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.34 
 
 
431 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.61 
 
 
428 aa  298  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.49 
 
 
429 aa  298  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.17 
 
 
416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.85 
 
 
419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.39 
 
 
442 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.58 
 
 
414 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.86 
 
 
440 aa  232  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.94 
 
 
417 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.72 
 
 
415 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.11 
 
 
508 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  36.91 
 
 
413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.42 
 
 
428 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.34 
 
 
418 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.12 
 
 
421 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.34 
 
 
392 aa  180  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30 
 
 
400 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30 
 
 
400 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.49 
 
 
397 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  33.9 
 
 
429 aa  178  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.72 
 
 
405 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  34.02 
 
 
418 aa  173  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.03 
 
 
416 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0717  diaminopimelate decarboxylase  35.29 
 
 
402 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0591874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.2 
 
 
388 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.25 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001062  vibrioferrin decarboxylase protein PvsE  30.45 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.9 
 
 
408 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4867  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.95 
 
 
373 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155396  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01927  diaminopimelate decarboxylase  35.62 
 
 
398 aa  156  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.86 
 
 
392 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3096  diaminopimelate decarboxylase  34.49 
 
 
394 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6954  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.96 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2332  diaminopimelate decarboxylase  31.94 
 
 
384 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.247782  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  34.91 
 
 
425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  34.56 
 
 
434 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.97 
 
 
362 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  31.4 
 
 
416 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  35.59 
 
 
427 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  31.33 
 
 
412 aa  152  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  32.17 
 
 
399 aa  151  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  35.38 
 
 
414 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  35.35 
 
 
427 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  30.31 
 
 
447 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  34.87 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  30.81 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4053  diaminopimelate decarboxylase  35.88 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  33.99 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  32.92 
 
 
416 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  33.07 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  30.81 
 
 
402 aa  146  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  29.6 
 
 
419 aa  146  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  31.15 
 
 
403 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  36.02 
 
 
423 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  33.81 
 
 
422 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  30.52 
 
 
417 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  30.54 
 
 
402 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  30.98 
 
 
434 aa  143  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  30.56 
 
 
418 aa  142  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  31.67 
 
 
417 aa  142  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  32.38 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  30.02 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  32.59 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3276  diaminopimelate decarboxylase  35.64 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  33.92 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  30.38 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  29.22 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1199  diaminopimelate decarboxylase  34.49 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0292186  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  33.99 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  31.19 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  30.69 
 
 
407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09300  diaminopimelate decarboxylase  35.47 
 
 
396 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000620759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  30.27 
 
 
417 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  32.93 
 
 
414 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 
419 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 
419 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  32.59 
 
 
421 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1136  diaminopimelate decarboxylase  33 
 
 
427 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  32.11 
 
 
416 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  31.22 
 
 
421 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  32.2 
 
 
414 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  33.98 
 
 
420 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0103305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>