More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0681 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 
416 aa  828    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  60.35 
 
 
418 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.1 
 
 
431 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.05 
 
 
429 aa  209  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.95 
 
 
428 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  38.12 
 
 
415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.48 
 
 
508 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.11 
 
 
411 aa  193  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.24 
 
 
414 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.44 
 
 
428 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.67 
 
 
416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.26 
 
 
415 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  35.88 
 
 
402 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.25 
 
 
442 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.43 
 
 
412 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.92 
 
 
411 aa  177  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.5 
 
 
440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.25 
 
 
414 aa  173  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  35.11 
 
 
402 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.22 
 
 
419 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  34.05 
 
 
413 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.88 
 
 
410 aa  169  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  33.59 
 
 
416 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.33 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  36.27 
 
 
408 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.48 
 
 
410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.25 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.5 
 
 
404 aa  166  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  33.42 
 
 
402 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.12 
 
 
430 aa  159  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33 
 
 
413 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.27 
 
 
405 aa  153  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33 
 
 
388 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.65 
 
 
409 aa  145  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  28.54 
 
 
417 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  30.57 
 
 
433 aa  144  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  31.81 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  28.79 
 
 
418 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  27.21 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  32.47 
 
 
418 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  28.12 
 
 
417 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  29.48 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  26.88 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.05 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4867  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.72 
 
 
373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.91 
 
 
400 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17190  diaminopimelate decarboxylase  27.68 
 
 
395 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.91 
 
 
400 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  31.91 
 
 
425 aa  133  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6954  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.3 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160275  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.68 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  29.21 
 
 
447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  30.52 
 
 
432 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2332  diaminopimelate decarboxylase  27.4 
 
 
384 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.247782  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.82 
 
 
402 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_002950  PG2188  diaminopimelate decarboxylase  28.42 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  26.63 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  29.14 
 
 
416 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  31.14 
 
 
422 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  29.23 
 
 
422 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  29.95 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  30.42 
 
 
394 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  30.63 
 
 
417 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4492  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  26.87 
 
 
415 aa  126  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.799972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  26.7 
 
 
417 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  25.42 
 
 
419 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0541  diaminopimelate decarboxylase  25.31 
 
 
421 aa  125  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.407931  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  27.81 
 
 
416 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  26.86 
 
 
412 aa  125  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  31.84 
 
 
429 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  30.42 
 
 
430 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  26.29 
 
 
401 aa  124  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  25.97 
 
 
417 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2675  diaminopimelate decarboxylase  30.98 
 
 
419 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  27.93 
 
 
421 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  29.8 
 
 
419 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.99 
 
 
408 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.06 
 
 
392 aa  123  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.12 
 
 
362 aa  123  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  29.6 
 
 
430 aa  122  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  28.8 
 
 
416 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  28.07 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  27.15 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  30 
 
 
422 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  28.64 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  30.85 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 
418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.14 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1016  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  30.23 
 
 
499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001062  vibrioferrin decarboxylase protein PvsE  29.07 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  27.2 
 
 
418 aa  121  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01927  diaminopimelate decarboxylase  31.23 
 
 
398 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  25.98 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0609  diaminopimelate decarboxylase  28 
 
 
437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.357283  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  26.18 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  25.62 
 
 
417 aa  120  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  29.28 
 
 
414 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.45 
 
 
421 aa  119  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3377  diaminopimelate decarboxylase  30.88 
 
 
452 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411773  normal  0.115373 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  29.38 
 
 
435 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>