More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3255 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 415 aa  845    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.25 
 
 		 416 aa  332  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.29 
 
 		 419 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.96 
 
 		 442 aa  242  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.88 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.55 
 
 		 414 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  33.25 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.68 
 
 		 410 aa  226  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.75 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  33.77 
 
 		 415 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.51 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.75 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.1 
 
 		 440 aa  223  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.42 
 
 		 411 aa  219  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.63 
 
 		 410 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.25 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  32.32 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.68 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.73 
 
 		 414 aa  212  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  31.55 
 
 		 402 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.15 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  32.8 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  31.3 
 
 		 402 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.48 
 
 		 430 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.38 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  33.6 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.68 
 
 		 508 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.54 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  30.88 
 
 		 416 aa  193  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.21 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.36 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  30.58 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  30.39 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  30.79 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  30.89 
 
 		 413 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  29.18 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  30.36 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  29.06 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  32.06 
 
 		 420 aa  183  6e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  33.6 
 
 		 412 aa  182  9.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  28.37 
 
 		 414 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  28.95 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  28.29 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  28.47 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  29.06 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  28.71 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  29.54 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  28.47 
 
 		 414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  27.85 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  30.22 
 
 		 417 aa  179  7e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  29.26 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  27.64 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  28.71 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  28.37 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.57 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.85 
 
 		 416 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  30.7 
 
 		 418 aa  176  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.42 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  29.9 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  28.54 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.75 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  28.19 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  27.87 
 
 		 412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  31.18 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  26.96 
 
 		 418 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  29.45 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0609  diaminopimelate decarboxylase  27.21 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.357283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  27.95 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  27.16 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  28.33 
 
 		 414 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  28.33 
 
 		 414 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  30.58 
 
 		 402 aa  170  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.84 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  30.58 
 
 		 402 aa  170  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.06 
 
 		 405 aa  169  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  32 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  29.41 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  28.09 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.024639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  28.04 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  29.53 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1136  diaminopimelate decarboxylase  29.3 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  27.56 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  30.45 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  28.05 
 
 		 418 aa  166  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3974  diaminopimelate decarboxylase  28.09 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  28.96 
 
 		 407 aa  166  8e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  29.85 
 
 		 445 aa  166  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000128402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  26.89 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  26.88 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  28.67 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  28.92 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  27.78 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  28.3 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  27.05 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0041  diaminopimelate decarboxylase  28.88 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.437243  hitchhiker  0.00781145 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1199  diaminopimelate decarboxylase  26.17 
 
 		 418 aa  163  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0292186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  26.98 
 
 		 427 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1365  diaminopimelate decarboxylase  29.56 
 
 		 423 aa  162  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00386973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  26.44 
 
 		 414 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  29.55 
 
 		 437 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>