More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1835 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 
430 aa  878    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.31 
 
 
411 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  45.73 
 
 
415 aa  340  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.07 
 
 
410 aa  333  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.51 
 
 
410 aa  333  4e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.5 
 
 
411 aa  332  7.000000000000001e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  41.77 
 
 
416 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  44.71 
 
 
402 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  41.87 
 
 
408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  43.93 
 
 
402 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  44.06 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.28 
 
 
414 aa  305  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.4 
 
 
412 aa  299  7e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.43 
 
 
413 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.36 
 
 
404 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.48 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.74 
 
 
404 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.16 
 
 
428 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.55 
 
 
408 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.52 
 
 
419 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.78 
 
 
429 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.18 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.25 
 
 
416 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.23 
 
 
440 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.21 
 
 
442 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.08 
 
 
414 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.27 
 
 
417 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.74 
 
 
415 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.38 
 
 
508 aa  193  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  34.41 
 
 
413 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.83 
 
 
428 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.73 
 
 
388 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.02 
 
 
405 aa  176  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.95 
 
 
397 aa  176  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.41 
 
 
392 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.71 
 
 
392 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.05 
 
 
400 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.05 
 
 
400 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.33 
 
 
418 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.88 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.12 
 
 
416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  32.65 
 
 
418 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.71 
 
 
408 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01927  diaminopimelate decarboxylase  34.99 
 
 
398 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.6 
 
 
362 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6954  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.96 
 
 
403 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160275  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0717  diaminopimelate decarboxylase  32.31 
 
 
402 aa  159  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0591874 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001062  vibrioferrin decarboxylase protein PvsE  29.55 
 
 
400 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4867  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.04 
 
 
373 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155396  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  28.1 
 
 
412 aa  153  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  29.22 
 
 
403 aa  150  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  29.77 
 
 
429 aa  146  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  30.67 
 
 
416 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.54 
 
 
421 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  26.8 
 
 
402 aa  143  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  26.8 
 
 
402 aa  143  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  30.75 
 
 
443 aa  143  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  26.8 
 
 
402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  30.85 
 
 
415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  30.29 
 
 
415 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  27.68 
 
 
407 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  27.35 
 
 
401 aa  139  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  27.06 
 
 
401 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  31.13 
 
 
420 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09300  diaminopimelate decarboxylase  31.85 
 
 
396 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000620759  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  28.03 
 
 
399 aa  138  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  30.39 
 
 
417 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  28.67 
 
 
434 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  32.88 
 
 
419 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  32.88 
 
 
419 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3096  diaminopimelate decarboxylase  30.15 
 
 
394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2332  diaminopimelate decarboxylase  28.27 
 
 
384 aa  136  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.247782  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  30.95 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  28.99 
 
 
419 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  29 
 
 
416 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  32.56 
 
 
418 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  30.6 
 
 
417 aa  133  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  29.3 
 
 
415 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  30.62 
 
 
421 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  30.54 
 
 
421 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0083  diaminopimelate decarboxylase  29.88 
 
 
432 aa  133  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4053  diaminopimelate decarboxylase  30.31 
 
 
484 aa  133  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  29.35 
 
 
420 aa  133  7.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  29.27 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  31.65 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  28.68 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  28.64 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  29.05 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  29.34 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  29.06 
 
 
415 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  28.98 
 
 
423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  28.53 
 
 
403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1199  diaminopimelate decarboxylase  31.58 
 
 
418 aa  130  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0292186  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0050  diaminopimelate decarboxylase  30.83 
 
 
423 aa  130  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  27.42 
 
 
419 aa  130  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  29.54 
 
 
416 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  28.81 
 
 
415 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  29.72 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3276  diaminopimelate decarboxylase  30.23 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0663  diaminopimelate decarboxylase  34.15 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>