More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56141 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_56141  protein involved in cell-cycle regulation of histone transcription  100 
 
 
959 aa  1979    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0125544  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01286  Protein hir1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDU4]  36.13 
 
 
1004 aa  352  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.472702 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02950  transcription corepressor, putative  38.19 
 
 
881 aa  302  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414493  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24854  predicted protein  29.01 
 
 
878 aa  219  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0065395 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83887  Histone transcription regulator HIRA, WD repeat superfamily  27.91 
 
 
993 aa  177  6e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.520766  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14166  predicted protein  27.34 
 
 
441 aa  146  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.55588  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33295  predicted protein  25.52 
 
 
1186 aa  123  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89595  predicted protein  25.19 
 
 
503 aa  119  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19333  predicted protein  25.92 
 
 
411 aa  113  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03785  component of the chromatin assembly complex (Eurofung)  30.7 
 
 
684 aa  110  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.73 
 
 
1217 aa  107  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.81 
 
 
1363 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06970  chromatin assembly complex protein, putative  33.49 
 
 
812 aa  104  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0273376  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.13 
 
 
696 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  22.81 
 
 
1831 aa  97.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.3 
 
 
919 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.07 
 
 
1652 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.49 
 
 
1357 aa  96.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.94 
 
 
1188 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.99 
 
 
1481 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.6 
 
 
1552 aa  95.5  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.73 
 
 
947 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.25 
 
 
1163 aa  94.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.27 
 
 
344 aa  92.8  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  25.58 
 
 
1183 aa  92.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.93 
 
 
1236 aa  92.8  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.41 
 
 
1196 aa  92.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.41 
 
 
1454 aa  92  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.68 
 
 
833 aa  91.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.77 
 
 
1686 aa  90.9  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.76 
 
 
1510 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.59 
 
 
1247 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  23.78 
 
 
1364 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.81 
 
 
1661 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  22.65 
 
 
1656 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.35 
 
 
1348 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.5 
 
 
1267 aa  88.6  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  24.94 
 
 
1878 aa  88.2  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.22 
 
 
740 aa  88.2  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  23.23 
 
 
1553 aa  87.4  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  22.59 
 
 
1789 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.74 
 
 
1609 aa  87.4  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24.45 
 
 
344 aa  87  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  24.31 
 
 
1766 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.13 
 
 
1240 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.29 
 
 
576 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.51 
 
 
1523 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.31 
 
 
1221 aa  85.5  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  22.72 
 
 
1477 aa  85.5  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.17 
 
 
924 aa  85.5  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.96 
 
 
1711 aa  85.1  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.84 
 
 
630 aa  85.1  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.43 
 
 
676 aa  84.7  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.16 
 
 
1209 aa  84.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  22.38 
 
 
1399 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.9 
 
 
1760 aa  84.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.24 
 
 
596 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  22.92 
 
 
1177 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  22.19 
 
 
1211 aa  83.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.57 
 
 
1004 aa  82.4  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.21 
 
 
675 aa  82.8  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  22.72 
 
 
1229 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  28.64 
 
 
335 aa  82  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.59 
 
 
1262 aa  81.6  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.56 
 
 
737 aa  81.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 
1714 aa  81.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  28.71 
 
 
1193 aa  81.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  29.15 
 
 
574 aa  80.5  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.65 
 
 
1858 aa  80.9  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  22.82 
 
 
1264 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
954 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  22.82 
 
 
1264 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.97 
 
 
1557 aa  80.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  23.06 
 
 
565 aa  79.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  21.62 
 
 
1164 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  25.66 
 
 
840 aa  79  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  29 
 
 
774 aa  79  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.3 
 
 
1304 aa  78.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.4 
 
 
464 aa  78.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.19 
 
 
930 aa  77.8  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  29.95 
 
 
1041 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.77 
 
 
865 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  23.42 
 
 
1242 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.91 
 
 
1607 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.27 
 
 
1411 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.64 
 
 
1213 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  27.23 
 
 
657 aa  77  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.93 
 
 
677 aa  77  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.85 
 
 
1188 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.19 
 
 
1583 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.16 
 
 
1598 aa  76.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  22.4 
 
 
1599 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.93 
 
 
682 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.46 
 
 
1623 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  23.22 
 
 
516 aa  75.5  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  28.64 
 
 
564 aa  75.5  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.61 
 
 
1039 aa  75.1  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.54 
 
 
1474 aa  75.1  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  25.06 
 
 
1190 aa  75.1  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  22.43 
 
 
1416 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>