59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83887 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_83887  Histone transcription regulator HIRA, WD repeat superfamily  100 
 
 		 993 aa  2042    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.520766  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01286  Protein hir1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDU4]  25.63 
 
 		 1004 aa  316  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.472702 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56141  protein involved in cell-cycle regulation of histone transcription  27.91 
 
 		 959 aa  177  9e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0125544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02950  transcription corepressor, putative  25.21 
 
 		 881 aa  127  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414493  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24854  predicted protein  22.58 
 
 		 878 aa  109  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0065395 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14166  predicted protein  20.15 
 
 		 441 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.55588  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89595  predicted protein  21.13 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33295  predicted protein  23.73 
 
 		 1186 aa  61.2  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.25 
 
 		 1209 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_539  predicted protein  21.79 
 
 		 719 aa  57.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.611801 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19333  predicted protein  22.14 
 
 		 411 aa  57  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.67 
 
 		 676 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  22.58 
 
 		 1217 aa  55.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.99 
 
 		 1760 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.2 
 
 		 737 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.15 
 
 		 1661 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.92 
 
 		 1599 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  22.44 
 
 		 1477 aa  52.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  22.3 
 
 		 1656 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.93 
 
 		 642 aa  52.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  21.79 
 
 		 1163 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  20 
 
 		 1213 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  22.5 
 
 		 1041 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  21.94 
 
 		 919 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.81 
 
 		 1004 aa  49.7  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.95 
 
 		 924 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  26.51 
 
 		 522 aa  49.7  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  22.31 
 
 		 1211 aa  48.5  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  23.05 
 
 		 1177 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.39 
 
 		 1711 aa  48.5  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10635  SepB protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00210]  21.21 
 
 		 836 aa  48.1  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.568063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  20.56 
 
 		 437 aa  48.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.67 
 
 		 1193 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.97 
 
 		 1262 aa  47.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03785  component of the chromatin assembly complex (Eurofung)  24.12 
 
 		 684 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06970  chromatin assembly complex protein, putative  27.6 
 
 		 812 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0273376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  22.76 
 
 		 1363 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.18 
 
 		 1411 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.68 
 
 		 1161 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.68 
 
 		 1161 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.48 
 
 		 596 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  21.96 
 
 		 1831 aa  46.2  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  23.44 
 
 		 1176 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.74 
 
 		 865 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  20.95 
 
 		 1553 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.96 
 
 		 1039 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  23.77 
 
 		 1117 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1789 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  21.27 
 
 		 1183 aa  45.8  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  24.1 
 
 		 1344 aa  45.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.16 
 
 		 1598 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  21.68 
 
 		 1188 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3830  WD-40 repeat protein  28.67 
 
 		 709 aa  45.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171146  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  21.81 
 
 		 1190 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.31 
 
 		 1623 aa  45.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 1221 aa  44.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  21.65 
 
 		 891 aa  44.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.39 
 
 		 1236 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.19 
 
 		 930 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>