81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33295 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_33295  predicted protein  100 
 
 		 1186 aa  2442    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24854  predicted protein  29.56 
 
 		 878 aa  164  7e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0065395 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02950  transcription corepressor, putative  29.59 
 
 		 881 aa  145  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414493  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01286  Protein hir1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDU4]  27.98 
 
 		 1004 aa  131  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.472702 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56141  protein involved in cell-cycle regulation of histone transcription  25.69 
 
 		 959 aa  120  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0125544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14166  predicted protein  26.49 
 
 		 441 aa  83.2  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.55588  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06970  chromatin assembly complex protein, putative  34.84 
 
 		 812 aa  76.3  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0273376  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03785  component of the chromatin assembly complex (Eurofung)  30.52 
 
 		 684 aa  74.3  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.85 
 
 		 1661 aa  72.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19333  predicted protein  26.32 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89595  predicted protein  25.58 
 
 		 503 aa  71.2  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1789 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83887  Histone transcription regulator HIRA, WD repeat superfamily  23.8 
 
 		 993 aa  62.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.520766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  28.16 
 
 		 1176 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.28 
 
 		 1190 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.92 
 
 		 1552 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  24.76 
 
 		 608 aa  56.6  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.74 
 
 		 1599 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.51 
 
 		 1364 aa  56.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.97 
 
 		 1711 aa  56.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 1177 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1599 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.57 
 
 		 1217 aa  55.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  26.58 
 
 		 335 aa  55.1  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1714 aa  55.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.45 
 
 		 1760 aa  55.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.3 
 
 		 1686 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  27.01 
 
 		 1304 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  22.22 
 
 		 1209 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.49 
 
 		 576 aa  52.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  23.24 
 
 		 1373 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  22.08 
 
 		 1016 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1196 aa  52  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.29 
 
 		 1583 aa  51.6  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26 
 
 		 919 aa  51.6  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  22.08 
 
 		 1016 aa  51.6  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.1 
 
 		 1523 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  28.48 
 
 		 1279 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 1221 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1424 aa  51.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  28.48 
 
 		 1279 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83023  predicted protein  28 
 
 		 763 aa  51.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.45 
 
 		 737 aa  50.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.99 
 
 		 1481 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  25.58 
 
 		 1656 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.77 
 
 		 733 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.17 
 
 		 1547 aa  49.3  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.14 
 
 		 676 aa  49.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.41 
 
 		 1267 aa  48.9  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  23.8 
 
 		 1188 aa  48.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1858 aa  48.9  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.06 
 
 		 1510 aa  48.9  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  21.58 
 
 		 1164 aa  48.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 		 344 aa  47.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1209 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.26 
 
 		 828 aa  47.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  22.63 
 
 		 1831 aa  48.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.67 
 
 		 1004 aa  47.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1214 aa  47  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  26.06 
 
 		 1344 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.35 
 
 		 1398 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  21.41 
 
 		 1161 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.65 
 
 		 1607 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  21.41 
 
 		 1161 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.29 
 
 		 1652 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  28.66 
 
 		 344 aa  46.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  23.27 
 
 		 782 aa  46.2  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.57 
 
 		 1609 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1263  WD-40 repeat protein  30.15 
 
 		 377 aa  46.6  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  20.92 
 
 		 1363 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.67 
 
 		 677 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  27.12 
 
 		 1348 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.04 
 
 		 696 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.72 
 
 		 596 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.64 
 
 		 1901 aa  45.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.03 
 
 		 1357 aa  45.8  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.85 
 
 		 1262 aa  45.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.66 
 
 		 1626 aa  45.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  26.38 
 
 		 1264 aa  45.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  21.36 
 
 		 1242 aa  45.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  26.38 
 
 		 1264 aa  45.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>