249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89595 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_89595  predicted protein  100 
 
 
503 aa  1041    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14166  predicted protein  33.75 
 
 
441 aa  230  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.55588  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03785  component of the chromatin assembly complex (Eurofung)  45.13 
 
 
684 aa  203  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19333  predicted protein  31.23 
 
 
411 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06970  chromatin assembly complex protein, putative  30.74 
 
 
812 aa  148  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0273376  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24854  predicted protein  27.7 
 
 
878 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0065395 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02950  transcription corepressor, putative  26.02 
 
 
881 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414493  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56141  protein involved in cell-cycle regulation of histone transcription  25.44 
 
 
959 aa  119  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0125544  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01286  Protein hir1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDU4]  24.61 
 
 
1004 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.472702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.18 
 
 
1760 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.11 
 
 
1164 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33295  predicted protein  26.51 
 
 
1186 aa  77  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.23 
 
 
576 aa  73.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.85 
 
 
1552 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.41 
 
 
1711 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.01 
 
 
919 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.69 
 
 
1686 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.72 
 
 
1481 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.24 
 
 
1190 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.48 
 
 
1831 aa  70.5  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.49 
 
 
696 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  24.19 
 
 
742 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  26.09 
 
 
597 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.37 
 
 
1247 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  21.05 
 
 
1217 aa  68.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.47 
 
 
1599 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.93 
 
 
740 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83887  Histone transcription regulator HIRA, WD repeat superfamily  21.28 
 
 
993 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.520766  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  27.88 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  24.59 
 
 
1176 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.18 
 
 
1209 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  21.94 
 
 
1193 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.45 
 
 
1357 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.18 
 
 
930 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 
1196 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.95 
 
 
1211 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  22.93 
 
 
589 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.88 
 
 
677 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  20.65 
 
 
1789 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.59 
 
 
596 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.7 
 
 
642 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  23.08 
 
 
1364 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  22.77 
 
 
652 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25.15 
 
 
1454 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.31 
 
 
1623 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  22.17 
 
 
687 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  23.26 
 
 
1100 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  19.43 
 
 
622 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  21.96 
 
 
443 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  22.46 
 
 
1858 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  21.37 
 
 
1348 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  21.93 
 
 
1163 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.57 
 
 
1510 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  22.13 
 
 
344 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.76 
 
 
1236 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.21 
 
 
1161 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  27.51 
 
 
511 aa  60.5  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  23.36 
 
 
565 aa  60.5  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  25.19 
 
 
1264 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.92 
 
 
1557 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  25.19 
 
 
1264 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  24.38 
 
 
1183 aa  59.7  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  20.83 
 
 
1367 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.11 
 
 
1213 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.32 
 
 
1477 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.63 
 
 
833 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  23.15 
 
 
1177 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  20 
 
 
1411 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.43 
 
 
1039 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.47 
 
 
1661 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.79 
 
 
1161 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  24.53 
 
 
405 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25 
 
 
675 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.37 
 
 
1523 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.31 
 
 
1004 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.7 
 
 
865 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  21.48 
 
 
947 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.21 
 
 
1188 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  40.96 
 
 
924 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  23.36 
 
 
1553 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  21.63 
 
 
1373 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  23.11 
 
 
540 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.56 
 
 
737 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  21.98 
 
 
1363 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  23.08 
 
 
505 aa  57.4  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.02 
 
 
1652 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.4 
 
 
676 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 
630 aa  57  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.08 
 
 
657 aa  56.6  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.69 
 
 
698 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  24.17 
 
 
1242 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  25.64 
 
 
1491 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.88 
 
 
898 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  24.19 
 
 
608 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.87 
 
 
1304 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.24 
 
 
1607 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.41 
 
 
1547 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  38.67 
 
 
1901 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_539  predicted protein  22.53 
 
 
719 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.611801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  23.63 
 
 
1714 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>