267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06970 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA06970  chromatin assembly complex protein, putative  100 
 
 
812 aa  1646    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0273376  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03785  component of the chromatin assembly complex (Eurofung)  35.42 
 
 
684 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89595  predicted protein  31.09 
 
 
503 aa  138  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24854  predicted protein  38.46 
 
 
878 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0065395 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14166  predicted protein  30.8 
 
 
441 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.55588  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19333  predicted protein  30.35 
 
 
411 aa  107  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56141  protein involved in cell-cycle regulation of histone transcription  33.49 
 
 
959 aa  104  8e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0125544  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02950  transcription corepressor, putative  34.07 
 
 
881 aa  93.6  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414493  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01286  Protein hir1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDU4]  30.11 
 
 
1004 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.472702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.95 
 
 
1831 aa  80.1  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.27 
 
 
576 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33295  predicted protein  35.06 
 
 
1186 aa  75.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  33.82 
 
 
1188 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  21.99 
 
 
1193 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  23.86 
 
 
696 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.34 
 
 
1686 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  31.25 
 
 
1221 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  26.96 
 
 
1209 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  32.35 
 
 
1474 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  28.74 
 
 
1161 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  28.74 
 
 
1161 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.98 
 
 
1789 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.51 
 
 
1247 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  27.59 
 
 
1714 aa  72  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.88 
 
 
1711 aa  71.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  30.96 
 
 
1364 aa  71.2  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.57 
 
 
919 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  32.87 
 
 
742 aa  70.1  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  36.76 
 
 
1552 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.84 
 
 
677 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.06 
 
 
1357 aa  70.5  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30 
 
 
596 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30.41 
 
 
1188 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  31.15 
 
 
1211 aa  68.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.83 
 
 
1196 aa  68.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  29.79 
 
 
1330 aa  68.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  26.11 
 
 
597 aa  68.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.88 
 
 
1760 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.11 
 
 
630 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.35 
 
 
1262 aa  68.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  36.69 
 
 
1399 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  29.08 
 
 
564 aa  67  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  30.57 
 
 
1229 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.45 
 
 
947 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.79 
 
 
1807 aa  67  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  22.36 
 
 
1163 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.78 
 
 
1363 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.5 
 
 
676 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.41 
 
 
1190 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  35 
 
 
335 aa  66.6  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.29 
 
 
1901 aa  65.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.46 
 
 
1039 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  30.5 
 
 
1213 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  26.85 
 
 
790 aa  65.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  24.72 
 
 
589 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.83 
 
 
1217 aa  65.1  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 
687 aa  65.1  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.35 
 
 
1454 aa  65.1  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  30.94 
 
 
1242 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.13 
 
 
1599 aa  64.7  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  27.78 
 
 
1599 aa  64.7  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.81 
 
 
1004 aa  64.7  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  29.15 
 
 
344 aa  64.7  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  32.12 
 
 
1523 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06160  Polyadenylation factor subunit 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZX0]  24.33 
 
 
567 aa  64.3  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.59 
 
 
740 aa  64.3  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  33.85 
 
 
344 aa  63.9  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.05 
 
 
1652 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  29.08 
 
 
1661 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.56 
 
 
664 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  33.58 
 
 
954 aa  63.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  27.78 
 
 
618 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.7 
 
 
1617 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.13 
 
 
642 aa  63.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  29.75 
 
 
608 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.19 
 
 
675 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  30.6 
 
 
1236 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.12 
 
 
1684 aa  62.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08017  catabolite degradation protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02400)  31.25 
 
 
827 aa  62.4  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0053965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  30.22 
 
 
565 aa  62  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  27.7 
 
 
1176 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  29.63 
 
 
578 aa  62  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  26.45 
 
 
1183 aa  62.4  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  30.43 
 
 
1427 aa  61.6  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  29.83 
 
 
511 aa  62  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  29.26 
 
 
1164 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.37 
 
 
833 aa  61.2  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.96 
 
 
1858 aa  61.6  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  31.37 
 
 
316 aa  61.2  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  27.4 
 
 
516 aa  60.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  30.88 
 
 
1041 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  25.44 
 
 
437 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  30.06 
 
 
1477 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.86 
 
 
930 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  33.82 
 
 
652 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.32 
 
 
1348 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  29.11 
 
 
540 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  31.01 
 
 
1214 aa  60.1  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  27.4 
 
 
872 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.25 
 
 
698 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>