More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI02950 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI02950  transcription corepressor, putative  100 
 
 
881 aa  1818    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414493  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24854  predicted protein  31.17 
 
 
878 aa  381  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0065395 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56141  protein involved in cell-cycle regulation of histone transcription  38.19 
 
 
959 aa  302  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0125544  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01286  Protein hir1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDU4]  36.67 
 
 
1004 aa  268  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.472702 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33295  predicted protein  29.59 
 
 
1186 aa  144  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83887  Histone transcription regulator HIRA, WD repeat superfamily  25.21 
 
 
993 aa  127  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.520766  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89595  predicted protein  25.74 
 
 
503 aa  122  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14166  predicted protein  26.1 
 
 
441 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.55588  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19333  predicted protein  26.5 
 
 
411 aa  111  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.66 
 
 
1686 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.65 
 
 
1652 aa  108  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03785  component of the chromatin assembly complex (Eurofung)  31.87 
 
 
684 aa  105  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.42 
 
 
696 aa  104  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
1831 aa  101  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.48 
 
 
1364 aa  99.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  28.53 
 
 
1247 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.67 
 
 
947 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.58 
 
 
1163 aa  98.6  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.19 
 
 
1523 aa  97.4  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.68 
 
 
1262 aa  97.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.99 
 
 
1363 aa  95.1  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.75 
 
 
1004 aa  94.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.17 
 
 
1481 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06970  chromatin assembly complex protein, putative  34.07 
 
 
812 aa  93.6  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0273376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.18 
 
 
677 aa  93.2  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.34 
 
 
1789 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28.34 
 
 
1188 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  29.09 
 
 
1193 aa  91.3  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.8 
 
 
1510 aa  90.9  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.25 
 
 
919 aa  90.9  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.9 
 
 
833 aa  90.9  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.67 
 
 
344 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.33 
 
 
1552 aa  90.5  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.52 
 
 
740 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.5 
 
 
1357 aa  89.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  24.5 
 
 
1229 aa  89.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  27.78 
 
 
1661 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  26.94 
 
 
344 aa  88.6  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.05 
 
 
1196 aa  88.6  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.5 
 
 
676 aa  87.8  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.93 
 
 
1217 aa  87.8  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.84 
 
 
682 aa  87.8  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.72 
 
 
865 aa  87.4  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.34 
 
 
1236 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.95 
 
 
1711 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  24.05 
 
 
443 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  24.76 
 
 
574 aa  86.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.14 
 
 
1553 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  29.3 
 
 
1714 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30 
 
 
792 aa  85.5  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.44 
 
 
576 aa  84.3  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.49 
 
 
1609 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.49 
 
 
1760 aa  84  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  28.96 
 
 
1209 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.66 
 
 
1164 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.19 
 
 
642 aa  83.2  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  32.09 
 
 
778 aa  83.2  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.16 
 
 
1221 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  27.51 
 
 
780 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  24.91 
 
 
316 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  28.33 
 
 
589 aa  82.4  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  26.94 
 
 
618 aa  82  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.1 
 
 
1454 aa  81.6  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.1 
 
 
737 aa  81.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.74 
 
 
842 aa  81.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  25.5 
 
 
1656 aa  81.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.95 
 
 
664 aa  81.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  28.69 
 
 
1878 aa  81.3  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  28.83 
 
 
1041 aa  81.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.77 
 
 
1474 aa  80.9  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.14 
 
 
1242 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.92 
 
 
596 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  24.32 
 
 
657 aa  80.9  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.07 
 
 
692 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  25.26 
 
 
317 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.52 
 
 
636 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  28.51 
 
 
774 aa  79  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.23 
 
 
675 aa  78.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.67 
 
 
1557 aa  79  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  26.98 
 
 
577 aa  78.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.93 
 
 
1443 aa  78.2  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  27.19 
 
 
1190 aa  78.2  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  26.53 
 
 
872 aa  78.2  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.64 
 
 
1039 aa  78.2  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.7 
 
 
630 aa  78.2  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  24.19 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  24.2 
 
 
840 aa  78.2  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  23.34 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.48 
 
 
1868 aa  77.8  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  21.55 
 
 
516 aa  77.4  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  23.67 
 
 
742 aa  77.4  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  22.91 
 
 
1901 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  26.91 
 
 
1214 aa  77  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  25.15 
 
 
522 aa  76.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.89 
 
 
1213 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  30.77 
 
 
1858 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.02 
 
 
1598 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.16 
 
 
1684 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.86 
 
 
733 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  28.52 
 
 
1176 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>