165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83023 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_83023  predicted protein  100 
 
 
763 aa  1573    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  21.72 
 
 
1454 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06240  negative regulation of gluconeogenesis-related protein, putative  32.88 
 
 
737 aa  84.7  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  22.8 
 
 
696 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.52 
 
 
1523 aa  81.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.03 
 
 
1652 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08017  catabolite degradation protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02400)  28.57 
 
 
827 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0053965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.56 
 
 
1760 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.46 
 
 
1193 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  21.54 
 
 
1357 aa  71.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.58 
 
 
1711 aa  70.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08183  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (Pwp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03090)  22.49 
 
 
851 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559435  normal  0.60601 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24 
 
 
1364 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  22.42 
 
 
1211 aa  69.3  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.34 
 
 
1363 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.77 
 
 
1163 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  20.35 
 
 
1247 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.98 
 
 
1557 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.21 
 
 
947 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  22.52 
 
 
1196 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  23.21 
 
 
1190 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.36 
 
 
1547 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  20.22 
 
 
1344 aa  65.1  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  21.46 
 
 
1901 aa  65.1  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  21.97 
 
 
1164 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  22.25 
 
 
1208 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.76 
 
 
1221 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  23.03 
 
 
1188 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  21.56 
 
 
1552 aa  62  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  22.29 
 
 
1443 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  22.39 
 
 
1661 aa  61.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.52 
 
 
1626 aa  60.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.27 
 
 
1236 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  27.07 
 
 
564 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.1 
 
 
1617 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.92 
 
 
1686 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.97 
 
 
692 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  26.82 
 
 
1152 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  19.05 
 
 
1831 aa  58.9  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  21.16 
 
 
565 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.97 
 
 
1161 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.44 
 
 
1609 aa  58.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17027  predicted protein  22.49 
 
 
500 aa  57.8  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.625475  normal  0.0184587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  19.8 
 
 
1209 aa  57.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  24.5 
 
 
317 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  20.63 
 
 
1217 aa  57  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.18 
 
 
1598 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24 
 
 
677 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  25.53 
 
 
1016 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  24.49 
 
 
316 aa  57  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  25.53 
 
 
1016 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  29.65 
 
 
589 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  20.75 
 
 
919 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  22.28 
 
 
728 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24854  predicted protein  21.46 
 
 
878 aa  56.6  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0065395 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.35 
 
 
1856 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  28.96 
 
 
597 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  21.28 
 
 
1807 aa  55.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  27.17 
 
 
1157 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.3 
 
 
1481 aa  54.7  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  22.09 
 
 
675 aa  54.7  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  22.51 
 
 
1177 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  26.21 
 
 
316 aa  54.7  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  19.72 
 
 
1311 aa  54.7  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.14 
 
 
1599 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  21.35 
 
 
924 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  21.32 
 
 
505 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  25.33 
 
 
346 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.27 
 
 
1583 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  22.08 
 
 
1399 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  20.31 
 
 
1714 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  22.46 
 
 
1656 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.84 
 
 
630 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.32 
 
 
1868 aa  53.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  24.38 
 
 
316 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  25.73 
 
 
1330 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  22.19 
 
 
1477 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  22.77 
 
 
1304 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.59 
 
 
1262 aa  52.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  23.84 
 
 
316 aa  52.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  19.58 
 
 
1367 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  20.37 
 
 
1474 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  21.15 
 
 
1209 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  21.88 
 
 
1553 aa  51.6  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53071  predicted protein  25.79 
 
 
935 aa  52  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  20.79 
 
 
1214 aa  51.6  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  27.27 
 
 
522 aa  51.2  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  21.78 
 
 
1161 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  22.27 
 
 
363 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33295  predicted protein  28 
 
 
1186 aa  51.2  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  24.06 
 
 
774 aa  50.8  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  20 
 
 
1348 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  21.15 
 
 
1176 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  21.76 
 
 
344 aa  50.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  22.27 
 
 
363 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  25.15 
 
 
772 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.39 
 
 
740 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.68 
 
 
657 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11703  predicted protein  25.88 
 
 
820 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  27.42 
 
 
618 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>