More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3677 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3677  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 363 aa  740    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0450  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  69.38 
 
 		 362 aa  502  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0133  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  66.2 
 
 		 359 aa  493  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2072  isocitrate dehydrogenase (NADP)  66.48 
 
 		 358 aa  475  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.311168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0575  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  64.15 
 
 		 358 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.879672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3538  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  60.72 
 
 		 368 aa  436  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.37 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  29.39 
 
 		 334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.37 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.37 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  28.65 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  30 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  27.75 
 
 		 482 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  28.41 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  26.59 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  26.18 
 
 		 339 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  28.22 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  29.4 
 
 		 478 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  26.87 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  27.67 
 
 		 472 aa  103  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  27.37 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1349  3-isopropylmalate dehydrogenase  28.93 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  28.69 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  25.94 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  29.55 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  29.55 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  29.55 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  27.6 
 
 		 480 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  29.55 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.25 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0172  isocitrate dehydrogenase  26.03 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  26.57 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1270  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.68 
 
 		 353 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1282  isocitrate dehydrogenase  27.58 
 
 		 407 aa  99.8  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393913  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.69 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  28.53 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  26.07 
 
 		 335 aa  99.8  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0212  isocitrate dehydrogenase  25.44 
 
 		 401 aa  99.4  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0938573  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1984  isocitrate dehydrogenase  27.58 
 
 		 483 aa  99  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.569508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0665  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.24 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0826839  normal  0.106014 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  28.08 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  29.26 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  28.9 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  27.6 
 
 		 481 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  27.84 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  29.55 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  28.85 
 
 		 326 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  29.55 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  29.55 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  29.55 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13371  isocitrate dehydrogenase  28.04 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.510485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2964  3-isopropylmalate dehydrogenase  27.67 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  26.27 
 
 		 348 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  29.55 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2488  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.65 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  28.61 
 
 		 336 aa  97.8  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4210  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  27.9 
 
 		 407 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  28.61 
 
 		 335 aa  97.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1459  isocitrate dehydrogenase  27.85 
 
 		 400 aa  96.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.362836  normal  0.369512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  26.88 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06080  isocitrate dehydrogenase  28.19 
 
 		 397 aa  96.7  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.54235 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1114  isocitrate dehydrogenase  30.26 
 
 		 482 aa  96.7  6e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  29.01 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3254  isocitrate dehydrogenase  26.33 
 
 		 402 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  26.49 
 
 		 377 aa  95.9  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  27.92 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2528  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.4 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000000300783  normal  0.0692405 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  25.95 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  28.38 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  27.76 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  28.21 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3530  isocitrate dehydrogenase  29.44 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00918215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  28.92 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  28.69 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1523  isocitrate dehydrogenase  26.11 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.030562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  26.7 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  30.05 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  27.89 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2662  3-isopropylmalate dehydrogenase  31.34 
 
 		 369 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  27.25 
 
 		 456 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7976  isocitrate dehydrogenase  28.82 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0285  isocitrate dehydrogenase  28.29 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.432651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  27.25 
 
 		 363 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  26.21 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0388  isocitrate dehydrogenase  29.09 
 
 		 407 aa  93.6  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0327  isocitrate dehydrogenase  26.98 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0890  isocitrate dehydrogenase  27.22 
 
 		 482 aa  93.6  5e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1602  isocitrate dehydrogenase  26.88 
 
 		 399 aa  93.6  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1281  isocitrate dehydrogenase  29.06 
 
 		 404 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000588967  normal  0.175146 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  28.07 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  27.91 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  25.68 
 
 		 361 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  25.68 
 
 		 361 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72104  Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial precursor (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (NADP(+)-specific ICDH) (IDP) (CtIDP1)  28.34 
 
 		 434 aa  92.8  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0911  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.55 
 
 		 404 aa  93.2  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  25.68 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  25.68 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  25.68 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  25.68 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  28.01 
 
 		 485 aa  92.8  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>