More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0450 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0450  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 362 aa  741    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0133  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  74.72 
 
 		 359 aa  561  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2072  isocitrate dehydrogenase (NADP)  76.82 
 
 		 358 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.311168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0575  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  70.22 
 
 		 358 aa  511  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.879672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3677  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  69.38 
 
 		 363 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3538  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  65.18 
 
 		 368 aa  477  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.81 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.81 
 
 		 360 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.81 
 
 		 360 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  29.83 
 
 		 478 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0172  isocitrate dehydrogenase  26.89 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  28.21 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  29.78 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  27.48 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  28.33 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  29.13 
 
 		 482 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0285  isocitrate dehydrogenase  27.9 
 
 		 402 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.432651  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  26.93 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  27.22 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  28.88 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  29.33 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0212  isocitrate dehydrogenase  27.69 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0938573  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  26.94 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  26.94 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  29.68 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  26.94 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  26.94 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  26.94 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  26.94 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  28.72 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  26.94 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6592  isocitrate dehydrogenase  28.68 
 
 		 410 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.685911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  26.65 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1114  isocitrate dehydrogenase  28.36 
 
 		 482 aa  103  3e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  29.04 
 
 		 485 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  29.25 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  27.2 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00190  tartrate dehydrogenase, putative  28.17 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0327  isocitrate dehydrogenase  26.32 
 
 		 403 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1984  isocitrate dehydrogenase  29.94 
 
 		 483 aa  102  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.569508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  26.67 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  29.06 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  29.36 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  28.81 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0890  isocitrate dehydrogenase  27.89 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  28.86 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.86 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  28.25 
 
 		 480 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0398  isocitrate dehydrogenase  28.46 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.287914  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  28.57 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  26.94 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2878  isocitrate dehydrogenase  27.07 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.367797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  27.52 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0446  isocitrate dehydrogenase  28.82 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1161  isocitrate dehydrogenase  28.53 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0210  isocitrate dehydrogenase  28.82 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.718507  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2099  isocitrate dehydrogenase  28.82 
 
 		 404 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.369839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  27.43 
 
 		 336 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4115  tartrate dehydrogenase  27.62 
 
 		 387 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  28.42 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  27.43 
 
 		 336 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  27.43 
 
 		 336 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0665  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  28.8 
 
 		 405 aa  99.4  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0826839  normal  0.106014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  28.53 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1559  isocitrate dehydrogenase  28.82 
 
 		 404 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1199  isocitrate dehydrogenase  28.53 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  28.06 
 
 		 330 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72104  Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial precursor (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (NADP(+)-specific ICDH) (IDP) (CtIDP1)  27.18 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2964  3-isopropylmalate dehydrogenase  26.51 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1267  isocitrate dehydrogenase  29.14 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3039  isocitrate dehydrogenase  29.02 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1282  isocitrate dehydrogenase  26.54 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393913  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5638  tartrate dehydrogenase  28.73 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  26.69 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1228  isocitrate dehydrogenase  26.91 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  27.43 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1349  3-isopropylmalate dehydrogenase  28.29 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  28.77 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3530  isocitrate dehydrogenase  28.27 
 
 		 407 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00918215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2528  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.97 
 
 		 422 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000000300783  normal  0.0692405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2247  tartrate dehydrogenase  27.55 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141085  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1519  isocitrate dehydrogenase  27.39 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.997525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2367  isocitrate dehydrogenase  28.24 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  27.05 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  28.65 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  27.43 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  27.43 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  28.17 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  28.17 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  28.17 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  28.17 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1222  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  26.85 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0593452  normal  0.0592242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3730  isocitrate dehydrogenase  28.21 
 
 		 403 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377053  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  27.71 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4569  isocitrate dehydrogenase  30.71 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0119875  normal  0.19569 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  27.01 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  27.07 
 
 		 339 aa  96.3  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2568  isocitrate dehydrogenase  29.48 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.55 
 
 		 326 aa  96.3  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  27.14 
 
 		 336 aa  96.3  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>