More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0575 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0575  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 358 aa  732    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.879672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0133  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  72.75 
 
 		 359 aa  541  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0450  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  70.22 
 
 		 362 aa  511  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2072  isocitrate dehydrogenase (NADP)  71.1 
 
 		 358 aa  508  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.311168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3538  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  63.33 
 
 		 368 aa  466  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3677  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  64.15 
 
 		 363 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  31.52 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  31.52 
 
 		 360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  31.52 
 
 		 360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  29.26 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.66 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  28.29 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  28.74 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  29.71 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  29.63 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  29.63 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  29.63 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  28.86 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  27.84 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  28.65 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  29.14 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  28.57 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  28.57 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  29.23 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  28.57 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  29.51 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  28.57 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  28.94 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.89 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  29.43 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1602  isocitrate dehydrogenase  27.86 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0212  isocitrate dehydrogenase  28.3 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0938573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.62 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72104  Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial precursor (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (NADP(+)-specific ICDH) (IDP) (CtIDP1)  27.82 
 
 		 434 aa  103  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593553 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1668  isocitrate dehydrogenase  27.36 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  28.99 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  28.2 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  26.58 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  26.58 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  28.37 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  27.27 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  26.58 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  26.85 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  26.99 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  26.58 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  26.58 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  26.58 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  26.58 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1161  isocitrate dehydrogenase  30.46 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1199  isocitrate dehydrogenase  30.46 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  28.41 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  26.57 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0327  isocitrate dehydrogenase  27.73 
 
 		 403 aa  99.8  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  30.47 
 
 		 330 aa  99.8  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  28.37 
 
 		 335 aa  99.4  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02999  Mitochondrial NADP-dependent isocitrate dehydrogenase (EC 1.1.1.42) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UN7]  27.7 
 
 		 493 aa  99  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.626077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  25.7 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0356  isocitrate dehydrogenase  28.64 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  28.38 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1282  isocitrate dehydrogenase  27.23 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0285  isocitrate dehydrogenase  28.07 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.432651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1349  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.69 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  27.17 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  28.73 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  27.1 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  26.69 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  26.88 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  28.41 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  26.32 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  27.17 
 
 		 364 aa  96.7  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  27.89 
 
 		 326 aa  97.1  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  27.9 
 
 		 359 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  28.24 
 
 		 335 aa  96.7  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  26.07 
 
 		 335 aa  96.7  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2488  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.19 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4210  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.29 
 
 		 407 aa  96.3  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  28.25 
 
 		 472 aa  96.3  7e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  28.05 
 
 		 362 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  25.57 
 
 		 335 aa  95.9  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  26.65 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2878  isocitrate dehydrogenase  27.36 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.367797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  26.8 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  27.99 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0621  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.7 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0240916 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  26.09 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0665  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.06 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0826839  normal  0.106014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1117  isocitrate dehydrogenase  29.39 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448977 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  27.57 
 
 		 355 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3530  isocitrate dehydrogenase  29.07 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00918215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  27.57 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  26.88 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0121  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.11 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.11 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0349763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0123  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.11 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  26.26 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1992  isocitrate dehydrogenase  29 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00890  tartrate dehydrogenase, putative  26.42 
 
 		 359 aa  94  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0210  isocitrate dehydrogenase  28.74 
 
 		 404 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.718507  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0446  isocitrate dehydrogenase  28.74 
 
 		 404 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.97 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>