More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3538 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3538  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 368 aa  740    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0133  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  65.57 
 
 		 359 aa  493  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2072  isocitrate dehydrogenase (NADP)  66.3 
 
 		 358 aa  481  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.311168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0450  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  65.18 
 
 		 362 aa  477  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0575  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  63.33 
 
 		 358 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.879672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3677  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  60.72 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.89 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.56 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.56 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.25 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  30.58 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  28.65 
 
 		 348 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  30.48 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0285  isocitrate dehydrogenase  28.24 
 
 		 402 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.432651  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  29.58 
 
 		 487 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  28.81 
 
 		 478 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  26.84 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  29.38 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.41 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0212  isocitrate dehydrogenase  25.76 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0938573  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1349  3-isopropylmalate dehydrogenase  27.37 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  28.82 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  28.61 
 
 		 480 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  31.58 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  28.53 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  29.41 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  30.64 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.33 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  29.2 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  29.13 
 
 		 335 aa  99.4  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  29.06 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.46 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1523  isocitrate dehydrogenase  27.42 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.030562  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3530  isocitrate dehydrogenase  30.27 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00918215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0327  isocitrate dehydrogenase  27.11 
 
 		 403 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  27.69 
 
 		 482 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.87 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2488  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.5 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  28.37 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  28.86 
 
 		 335 aa  96.3  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  28.49 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  28.05 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1114  isocitrate dehydrogenase  26.04 
 
 		 482 aa  94.7  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  28 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2576  isocitrate dehydrogenase  27.27 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.050087  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0013  tartrate dehydrogenase  29.44 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  28 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  30.9 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  27.61 
 
 		 335 aa  93.6  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  27.97 
 
 		 334 aa  93.2  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  27.87 
 
 		 361 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  25.2 
 
 		 472 aa  93.2  7e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  27.87 
 
 		 361 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  28 
 
 		 336 aa  93.2  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  27.87 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2662  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.62 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  30.17 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  27.87 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  27.42 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  27.87 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  28.29 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  28.39 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  27.87 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  27.87 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  27.84 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  27.87 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  29.75 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  28.08 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  28.31 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  28.08 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  28.08 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  27.52 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  28.08 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  27.64 
 
 		 336 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  27.64 
 
 		 336 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  27.64 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  28 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  27.87 
 
 		 361 aa  91.3  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  27.32 
 
 		 480 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  27.64 
 
 		 336 aa  90.5  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  30.99 
 
 		 334 aa  90.1  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1270  3-isopropylmalate dehydrogenase  28.18 
 
 		 353 aa  89.7  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.29 
 
 		 331 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  28 
 
 		 336 aa  89.4  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  28.73 
 
 		 364 aa  89.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72104  Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial precursor (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (NADP(+)-specific ICDH) (IDP) (CtIDP1)  26.81 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  27.08 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0665  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.24 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0826839  normal  0.106014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.19 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0890  isocitrate dehydrogenase  25.21 
 
 		 482 aa  88.2  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  27.42 
 
 		 481 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1459  isocitrate dehydrogenase  28.07 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.362836  normal  0.369512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  28.53 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1602  isocitrate dehydrogenase  27.12 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  28.85 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4569  isocitrate dehydrogenase  27.9 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0119875  normal  0.19569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  29.73 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  28.27 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1668  isocitrate dehydrogenase  27.08 
 
 		 399 aa  86.7  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  29 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0498293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>