More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0133 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0133  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 359 aa  733    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0450  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  74.72 
 
 		 362 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2072  isocitrate dehydrogenase (NADP)  73.11 
 
 		 358 aa  552  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.311168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0575  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  72.75 
 
 		 358 aa  541  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.879672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3677  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  66.2 
 
 		 363 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3538  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  65.57 
 
 		 368 aa  493  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.34 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.14 
 
 		 360 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.14 
 
 		 360 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72104  Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial precursor (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (NADP(+)-specific ICDH) (IDP) (CtIDP1)  30.86 
 
 		 434 aa  116  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593553 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0212  isocitrate dehydrogenase  27.76 
 
 		 401 aa  116  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0938573  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  30.48 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.44 
 
 		 360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1282  isocitrate dehydrogenase  30.02 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393913  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  30.11 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  30.11 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  29.75 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  29.75 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  28.57 
 
 		 478 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  27.59 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  29.75 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  29.75 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  29.75 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  29.46 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  29.75 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0665  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.89 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0826839  normal  0.106014 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  29.66 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  29.63 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1602  isocitrate dehydrogenase  28.46 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  27.89 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  29.63 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1668  isocitrate dehydrogenase  28.11 
 
 		 399 aa  106  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  29.3 
 
 		 349 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1281  isocitrate dehydrogenase  30.42 
 
 		 404 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000588967  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  30.03 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  29.83 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04090  isocitrate dehydrogenase (NADP+), putative  29.77 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00968554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3007  isocitrate dehydrogenase  29.92 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.375346  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0356  isocitrate dehydrogenase  29.29 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  29.06 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  29.11 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0327  isocitrate dehydrogenase  27.23 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  28.45 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  29.66 
 
 		 472 aa  103  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0285  isocitrate dehydrogenase  28.01 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.432651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  28.23 
 
 		 480 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0398  isocitrate dehydrogenase  29.35 
 
 		 406 aa  102  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.287914  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3530  isocitrate dehydrogenase  29.34 
 
 		 407 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00918215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7976  isocitrate dehydrogenase  29.58 
 
 		 410 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2528  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.79 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000000300783  normal  0.0692405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6592  isocitrate dehydrogenase  30.11 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.685911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  27.4 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  29.78 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  28.02 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4210  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.31 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  28.37 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2568  isocitrate dehydrogenase  31.91 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.14 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  28.06 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4413  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.87 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0457  isocitrate dehydrogenase  29.88 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0527606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.24 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  28.69 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1161  isocitrate dehydrogenase  30.89 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  27.78 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  26.01 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3730  isocitrate dehydrogenase  30.05 
 
 		 403 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377053  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_004310  BR1199  isocitrate dehydrogenase  32.7 
 
 		 404 aa  99.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  27.61 
 
 		 339 aa  99.8  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1254  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  30.63 
 
 		 404 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1992  isocitrate dehydrogenase  30.1 
 
 		 404 aa  99.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1114  isocitrate dehydrogenase  27.25 
 
 		 482 aa  99.4  8e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  31.27 
 
 		 361 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1913  isocitrate dehydrogenase  29.85 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1222  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  28.96 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0593452  normal  0.0592242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1349  3-isopropylmalate dehydrogenase  27.89 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02999  Mitochondrial NADP-dependent isocitrate dehydrogenase (EC 1.1.1.42) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UN7]  27.85 
 
 		 493 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.626077  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  27.5 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2367  isocitrate dehydrogenase  30.97 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1117  isocitrate dehydrogenase  30.48 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  27.62 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1523  isocitrate dehydrogenase  28.42 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.030562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  27.97 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0911  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  31.23 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  27.5 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  28.14 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  26.76 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43870  Isocitrate dehydrogenase [NADP] peroxisomal (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (PS-NADP-IDH) (CtIDP2)  29.09 
 
 		 410 aa  97.4  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  27.38 
 
 		 485 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3039  isocitrate dehydrogenase  31.16 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0388  isocitrate dehydrogenase  30.69 
 
 		 407 aa  97.4  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  27.5 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13371  isocitrate dehydrogenase  29.89 
 
 		 409 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.510485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  27.64 
 
 		 335 aa  97.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  27.5 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  27.1 
 
 		 481 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4569  isocitrate dehydrogenase  30.85 
 
 		 404 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0119875  normal  0.19569 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  27.5 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  27.5 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4814  isocitrate dehydrogenase  29.58 
 
 		 404 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0820117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>