225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2568 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1992  isocitrate dehydrogenase  75.86 
 
 		 404 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7976  isocitrate dehydrogenase  76.98 
 
 		 410 aa  673    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4569  isocitrate dehydrogenase  75.37 
 
 		 404 aa  643    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0119875  normal  0.19569 
 
 
-
 
NC_004310  BR1199  isocitrate dehydrogenase  75.86 
 
 		 404 aa  641    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3988  isocitrate dehydrogenase  80.74 
 
 		 404 aa  696    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2568  isocitrate dehydrogenase  100 
 
 		 406 aa  841    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1254  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  80.49 
 
 		 404 aa  691    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0356  isocitrate dehydrogenase  74.63 
 
 		 405 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3007  isocitrate dehydrogenase  79.75 
 
 		 405 aa  688    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.375346  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13371  isocitrate dehydrogenase  78.41 
 
 		 409 aa  669    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.510485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1282  isocitrate dehydrogenase  74.57 
 
 		 407 aa  634    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393913  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0665  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  79.56 
 
 		 405 aa  686    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0826839  normal  0.106014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3960  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  89.38 
 
 		 405 aa  772    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.797377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1222  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  80.45 
 
 		 405 aa  703    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0593452  normal  0.0592242 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1964  isocitrate dehydrogenase  74.63 
 
 		 404 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.431704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1267  isocitrate dehydrogenase  75.86 
 
 		 404 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05050  isocitrate dehydrogenase  87.16 
 
 		 407 aa  744    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6478  isocitrate dehydrogenase  79.56 
 
 		 406 aa  687    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1281  isocitrate dehydrogenase  79.01 
 
 		 404 aa  673    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000588967  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2528  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  82.18 
 
 		 422 aa  704    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000000300783  normal  0.0692405 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0388  isocitrate dehydrogenase  79.56 
 
 		 407 aa  691    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0685  isocitrate dehydrogenase  80.74 
 
 		 406 aa  701    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4173  isocitrate dehydrogenase  81.73 
 
 		 404 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0398  isocitrate dehydrogenase  75.06 
 
 		 406 aa  647    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.287914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0911  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  76.73 
 
 		 404 aa  671    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4413  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  79.26 
 
 		 404 aa  684    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4210  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  86.63 
 
 		 407 aa  739    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3793  isocitrate dehydrogenase  81.48 
 
 		 404 aa  695    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0923125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1117  isocitrate dehydrogenase  75.8 
 
 		 404 aa  649    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448977 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0565  isocitrate dehydrogenase  73.83 
 
 		 409 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2631  isocitrate dehydrogenase  75.12 
 
 		 404 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1161  isocitrate dehydrogenase  76.11 
 
 		 404 aa  643    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1913  isocitrate dehydrogenase  73.15 
 
 		 404 aa  631  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0446  isocitrate dehydrogenase  73.89 
 
 		 404 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1559  isocitrate dehydrogenase  73.89 
 
 		 404 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3530  isocitrate dehydrogenase  73.15 
 
 		 407 aa  634  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00918215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3732  isocitrate dehydrogenase  72.84 
 
 		 408 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0210  isocitrate dehydrogenase  73.89 
 
 		 404 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.718507  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2099  isocitrate dehydrogenase  74.14 
 
 		 404 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.369839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4362  isocitrate dehydrogenase  73.76 
 
 		 407 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2367  isocitrate dehydrogenase  73.89 
 
 		 404 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3039  isocitrate dehydrogenase  73.89 
 
 		 404 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4814  isocitrate dehydrogenase  73.89 
 
 		 404 aa  628  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0820117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1011  isocitrate dehydrogenase  72.66 
 
 		 411 aa  628  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2961  isocitrate dehydrogenase  74.63 
 
 		 404 aa  628  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0688602  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5427  isocitrate dehydrogenase  73.89 
 
 		 405 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444249  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1133  isocitrate dehydrogenase  72.59 
 
 		 405 aa  626  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.994412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1576  isocitrate dehydrogenase  74 
 
 		 407 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1737  isocitrate dehydrogenase  73.02 
 
 		 407 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5765  isocitrate dehydrogenase  72.84 
 
 		 404 aa  625  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1519  isocitrate dehydrogenase  74.14 
 
 		 404 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.997525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2545  isocitrate dehydrogenase  72.35 
 
 		 405 aa  623  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1953  isocitrate dehydrogenase  72.59 
 
 		 403 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123809  normal  0.403096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2164  isocitrate dehydrogenase  72.1 
 
 		 403 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0263756  normal  0.0589058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1294  isocitrate dehydrogenase  72.35 
 
 		 403 aa  619  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.471014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0743  isocitrate dehydrogenase  73.09 
 
 		 404 aa  620  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.262028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3527  isocitrate dehydrogenase  72.66 
 
 		 404 aa  618  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43028  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0457  isocitrate dehydrogenase  72.1 
 
 		 406 aa  617  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0527606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2580  isocitrate dehydrogenase  71.11 
 
 		 407 aa  617  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0101084  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1623  isocitrate dehydrogenase  72.84 
 
 		 405 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3338  isocitrate dehydrogenase  74.57 
 
 		 404 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3463  isocitrate dehydrogenase  74.32 
 
 		 404 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3141  isocitrate dehydrogenase  74.32 
 
 		 404 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120498  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2372  isocitrate dehydrogenase  72.91 
 
 		 404 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3730  isocitrate dehydrogenase  71.95 
 
 		 403 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377053  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1228  isocitrate dehydrogenase  70.1 
 
 		 410 aa  597  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6592  isocitrate dehydrogenase  70.34 
 
 		 410 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.685911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4767  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  68.45 
 
 		 405 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04090  isocitrate dehydrogenase (NADP+), putative  64.79 
 
 		 449 aa  555  1e-157  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00968554  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72104  Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial precursor (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (NADP(+)-specific ICDH) (IDP) (CtIDP1)  66.34 
 
 		 434 aa  556  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593553 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02999  Mitochondrial NADP-dependent isocitrate dehydrogenase (EC 1.1.1.42) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UN7]  66.34 
 
 		 493 aa  552  1e-156  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.626077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43870  Isocitrate dehydrogenase [NADP] peroxisomal (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (PS-NADP-IDH) (CtIDP2)  64.62 
 
 		 410 aa  534  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0285  isocitrate dehydrogenase  58.63 
 
 		 402 aa  471  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.432651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0327  isocitrate dehydrogenase  57.11 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3254  isocitrate dehydrogenase  54.98 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1523  isocitrate dehydrogenase  54.36 
 
 		 403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.030562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1668  isocitrate dehydrogenase  56.05 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1602  isocitrate dehydrogenase  56.05 
 
 		 399 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2576  isocitrate dehydrogenase  54.61 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.050087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1459  isocitrate dehydrogenase  52.49 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.362836  normal  0.369512 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06080  isocitrate dehydrogenase  53.25 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.54235 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0212  isocitrate dehydrogenase  54.48 
 
 		 401 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0938573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2878  isocitrate dehydrogenase  51.5 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.367797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14762  isocitrate dehydrogenase  34.54 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29641  predicted protein  31.45 
 
 		 409 aa  176  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47417  predicted protein  31.28 
 
 		 397 aa  172  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0133  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  31.91 
 
 		 359 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0450  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  29.48 
 
 		 362 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0575  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  28.82 
 
 		 358 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.879672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3677  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  30 
 
 		 363 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2072  isocitrate dehydrogenase (NADP)  30.37 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.311168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3538  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  28.69 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2330  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  28.24 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  29 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0878  isocitrate dehydrogenase  27.24 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0849  isocitrate dehydrogenase  27.24 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  27.19 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2939  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  27.31 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  27.07 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  27.07 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>