108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0911 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1199  isocitrate dehydrogenase  75.93 
 
 
404 aa  661    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3960  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  79.75 
 
 
405 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.797377  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2568  isocitrate dehydrogenase  76.73 
 
 
406 aa  671    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0356  isocitrate dehydrogenase  75.25 
 
 
405 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3732  isocitrate dehydrogenase  74.44 
 
 
408 aa  646    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1282  isocitrate dehydrogenase  77.78 
 
 
407 aa  669    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1576  isocitrate dehydrogenase  73.68 
 
 
407 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1737  isocitrate dehydrogenase  74.19 
 
 
407 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1964  isocitrate dehydrogenase  75.68 
 
 
404 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.431704  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1267  isocitrate dehydrogenase  76.18 
 
 
404 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1011  isocitrate dehydrogenase  75.68 
 
 
411 aa  644    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0388  isocitrate dehydrogenase  77.17 
 
 
407 aa  675    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3793  isocitrate dehydrogenase  78.95 
 
 
404 aa  682    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0923125  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2367  isocitrate dehydrogenase  75.43 
 
 
404 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3039  isocitrate dehydrogenase  74.94 
 
 
404 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0565  isocitrate dehydrogenase  75.43 
 
 
409 aa  663    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1161  isocitrate dehydrogenase  76.18 
 
 
404 aa  664    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0457  isocitrate dehydrogenase  73.7 
 
 
406 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0527606  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1519  isocitrate dehydrogenase  74.44 
 
 
404 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.997525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3988  isocitrate dehydrogenase  77.42 
 
 
404 aa  677    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1992  isocitrate dehydrogenase  74.94 
 
 
404 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2580  isocitrate dehydrogenase  73.45 
 
 
407 aa  644    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0101084  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4413  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  80.89 
 
 
404 aa  703    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4569  isocitrate dehydrogenase  74.44 
 
 
404 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0119875  normal  0.19569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4173  isocitrate dehydrogenase  78.45 
 
 
404 aa  679    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2631  isocitrate dehydrogenase  74.94 
 
 
404 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4362  isocitrate dehydrogenase  74.69 
 
 
407 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1117  isocitrate dehydrogenase  75.19 
 
 
404 aa  652    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.448977 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1953  isocitrate dehydrogenase  74.69 
 
 
403 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123809  normal  0.403096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3530  isocitrate dehydrogenase  73.7 
 
 
407 aa  644    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00918215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4814  isocitrate dehydrogenase  74.19 
 
 
404 aa  643    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0820117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1913  isocitrate dehydrogenase  74.44 
 
 
404 aa  658    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0665  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  80.15 
 
 
405 aa  697    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0826839  normal  0.106014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3007  isocitrate dehydrogenase  79.21 
 
 
405 aa  677    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.375346  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2164  isocitrate dehydrogenase  74.69 
 
 
403 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0263756  normal  0.0589058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6478  isocitrate dehydrogenase  77.48 
 
 
406 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7976  isocitrate dehydrogenase  87.28 
 
 
410 aa  748    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05050  isocitrate dehydrogenase  77.23 
 
 
407 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178369  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0685  isocitrate dehydrogenase  79.7 
 
 
406 aa  683    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2528  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  80.2 
 
 
422 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000000300783  normal  0.0692405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1281  isocitrate dehydrogenase  80.45 
 
 
404 aa  683    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000588967  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4210  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  79.21 
 
 
407 aa  684    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1254  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  84.37 
 
 
404 aa  726    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1222  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  79.05 
 
 
405 aa  672    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0593452  normal  0.0592242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0911  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  100 
 
 
404 aa  837    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1133  isocitrate dehydrogenase  71.71 
 
 
405 aa  631  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.994412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1294  isocitrate dehydrogenase  72.46 
 
 
403 aa  629  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.471014  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1559  isocitrate dehydrogenase  73.95 
 
 
404 aa  627  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0210  isocitrate dehydrogenase  73.95 
 
 
404 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.718507  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2099  isocitrate dehydrogenase  74.19 
 
 
404 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.369839  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5427  isocitrate dehydrogenase  73.45 
 
 
405 aa  628  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444249  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3527  isocitrate dehydrogenase  72.21 
 
 
404 aa  629  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43028  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5765  isocitrate dehydrogenase  72.7 
 
 
404 aa  628  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842512  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2545  isocitrate dehydrogenase  71.46 
 
 
405 aa  628  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104779  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0446  isocitrate dehydrogenase  73.95 
 
 
404 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2961  isocitrate dehydrogenase  74.69 
 
 
404 aa  624  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0688602  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13371  isocitrate dehydrogenase  72.89 
 
 
409 aa  621  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.510485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1623  isocitrate dehydrogenase  71.46 
 
 
405 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0743  isocitrate dehydrogenase  69.98 
 
 
404 aa  617  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.262028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3730  isocitrate dehydrogenase  70.83 
 
 
403 aa  619  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377053  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3338  isocitrate dehydrogenase  73.95 
 
 
404 aa  615  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0398  isocitrate dehydrogenase  70.79 
 
 
406 aa  616  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.287914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1228  isocitrate dehydrogenase  69.12 
 
 
410 aa  610  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3141  isocitrate dehydrogenase  73.2 
 
 
404 aa  608  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120498  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3463  isocitrate dehydrogenase  73.2 
 
 
404 aa  609  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72104  Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial precursor (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (NADP(+)-specific ICDH) (IDP) (CtIDP1)  70.02 
 
 
434 aa  601  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0593553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6592  isocitrate dehydrogenase  68.97 
 
 
410 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.685911  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4767  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  68.78 
 
 
405 aa  599  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2372  isocitrate dehydrogenase  70.97 
 
 
404 aa  597  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04090  isocitrate dehydrogenase (NADP+), putative  68.06 
 
 
449 aa  592  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00968554  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02999  Mitochondrial NADP-dependent isocitrate dehydrogenase (EC 1.1.1.42) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UN7]  68.15 
 
 
493 aa  590  1e-167  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.626077  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43870  Isocitrate dehydrogenase [NADP] peroxisomal (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (PS-NADP-IDH) (CtIDP2)  65.27 
 
 
410 aa  563  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0285  isocitrate dehydrogenase  54.36 
 
 
402 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.432651  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1459  isocitrate dehydrogenase  54.23 
 
 
400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.362836  normal  0.369512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3254  isocitrate dehydrogenase  53.62 
 
 
402 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06080  isocitrate dehydrogenase  54.14 
 
 
397 aa  449  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.54235 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1602  isocitrate dehydrogenase  52.48 
 
 
399 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0327  isocitrate dehydrogenase  52.99 
 
 
403 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1523  isocitrate dehydrogenase  53.5 
 
 
403 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.030562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1668  isocitrate dehydrogenase  52.23 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2576  isocitrate dehydrogenase  51.98 
 
 
402 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.050087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2878  isocitrate dehydrogenase  52.26 
 
 
400 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.367797  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0212  isocitrate dehydrogenase  51.84 
 
 
401 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0938573  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14762  isocitrate dehydrogenase  33.33 
 
 
357 aa  168  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29641  predicted protein  32.35 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47417  predicted protein  32.19 
 
 
397 aa  162  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0133  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  31.23 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3677  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  30.55 
 
 
363 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0575  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  29.31 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.879672  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0450  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  27.38 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2072  isocitrate dehydrogenase (NADP)  30.17 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.311168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3538  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  27.12 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  26.25 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  27.95 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  27.54 
 
 
389 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  25.97 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2939  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  26.55 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2895  isocitrate dehydrogenase  25.3 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.328131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  24.21 
 
 
411 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  27.4 
 
 
336 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>