More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23721 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_19421  ribonuclease E/G  56.79 
 
 		 640 aa  714    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.839153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1067  RNAse E  62.86 
 
 		 640 aa  716    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.232877  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23721  ribonuclease E/G  100 
 
 		 647 aa  1281    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2029  ribonuclease E and G  77.72 
 
 		 646 aa  861    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0313  RNAse E  75.08 
 
 		 646 aa  887    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16241  ribonuclease E/G  64.27 
 
 		 624 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16811  ribonuclease E/G  52.63 
 
 		 608 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  54.35 
 
 		 602 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1593  ribonuclease  55.31 
 
 		 605 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.435522  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17041  ribonuclease E/G  55.39 
 
 		 606 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.925066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  70.87 
 
 		 687 aa  615  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  68.93 
 
 		 713 aa  605  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3404  ribonuclease, Rne/Rng family  69.17 
 
 		 669 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  69.38 
 
 		 808 aa  602  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  67.54 
 
 		 653 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0483  ribonuclease  68.61 
 
 		 682 aa  594  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.582828  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  67.54 
 
 		 653 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  67.72 
 
 		 645 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  40.92 
 
 		 559 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  41.3 
 
 		 564 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  40.75 
 
 		 411 aa  290  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  42.09 
 
 		 702 aa  287  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  37.31 
 
 		 494 aa  286  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  41.94 
 
 		 908 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  41.69 
 
 		 496 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  41.69 
 
 		 1007 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  40.13 
 
 		 562 aa  282  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  40.77 
 
 		 571 aa  277  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  39.9 
 
 		 1041 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  41.76 
 
 		 990 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  39.75 
 
 		 543 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  37.76 
 
 		 476 aa  273  6e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  40.96 
 
 		 1093 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  40.65 
 
 		 1024 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  40.28 
 
 		 1058 aa  269  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  39.28 
 
 		 1113 aa  269  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  44.47 
 
 		 416 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  39.68 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  40.67 
 
 		 717 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  42.07 
 
 		 1334 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  39.51 
 
 		 1123 aa  268  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  40.52 
 
 		 922 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  41.11 
 
 		 1151 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  39.75 
 
 		 636 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  39.77 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  38.36 
 
 		 1265 aa  264  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  39.36 
 
 		 1194 aa  264  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  42.29 
 
 		 959 aa  263  6e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  41.07 
 
 		 1427 aa  262  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  39.05 
 
 		 497 aa  260  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  36.02 
 
 		 1022 aa  259  9e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  39.16 
 
 		 1080 aa  259  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  36.63 
 
 		 512 aa  258  2e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  39.01 
 
 		 952 aa  259  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  40.58 
 
 		 974 aa  257  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  36.73 
 
 		 483 aa  257  5e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  39.19 
 
 		 1043 aa  257  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  37.11 
 
 		 1093 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  38.56 
 
 		 1072 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  38.16 
 
 		 489 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  40.05 
 
 		 1048 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1481  ribonuclease  38.56 
 
 		 1086 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00984617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  38 
 
 		 1128 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3809  ribonuclease  38.56 
 
 		 1090 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000518974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  38.56 
 
 		 1139 aa  254  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1905  ribonuclease, Rne/Rng family  38.56 
 
 		 1091 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.879394  unclonable  0.000000947805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  38.25 
 
 		 1120 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  38.06 
 
 		 1082 aa  253  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  38.21 
 
 		 1012 aa  253  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  38.84 
 
 		 503 aa  253  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  39.26 
 
 		 1040 aa  253  9.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  39 
 
 		 1057 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  38.81 
 
 		 1073 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  40.11 
 
 		 1091 aa  252  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  38.35 
 
 		 489 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  37.53 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  40.16 
 
 		 1117 aa  252  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  37.66 
 
 		 496 aa  252  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  37.66 
 
 		 496 aa  252  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  37.36 
 
 		 741 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  37.78 
 
 		 1035 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002988  ribonuclease E  38.02 
 
 		 1024 aa  251  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  37.74 
 
 		 489 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1615  ribonuclease, Rne/Rng family  37.13 
 
 		 1058 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000319313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  37.27 
 
 		 492 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  36.25 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  39.89 
 
 		 1244 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  39.17 
 
 		 944 aa  248  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1490  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.88 
 
 		 1124 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.326409  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  34.35 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  37.74 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  40.99 
 
 		 1070 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  36.83 
 
 		 987 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  36.83 
 
 		 991 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  36.83 
 
 		 991 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1989  ribonuclease E  36.39 
 
 		 1141 aa  246  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378047  normal  0.0201653 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  37.5 
 
 		 528 aa  247  6e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1579  ribonuclease, Rne/Rng family  36.88 
 
 		 1060 aa  246  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00521114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1898  ribonuclease E  36.63 
 
 		 1122 aa  246  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000446531  hitchhiker  0.000483574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  40.55 
 
 		 474 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>