More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1453 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  100 
 
 		 416 aa  845    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  57.77 
 
 		 559 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  55.69 
 
 		 564 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  50.24 
 
 		 562 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  44.07 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  47.22 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  47.2 
 
 		 571 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  46.03 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  46.08 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  46.26 
 
 		 531 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  45.84 
 
 		 496 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  45.94 
 
 		 503 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  44.15 
 
 		 411 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  45.41 
 
 		 492 aa  345  8.999999999999999e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  43.61 
 
 		 517 aa  343  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  46.5 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  45.67 
 
 		 489 aa  343  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  45.67 
 
 		 489 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  43.97 
 
 		 492 aa  340  4e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  44.47 
 
 		 489 aa  339  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  42.31 
 
 		 487 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  44.47 
 
 		 1007 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  43.48 
 
 		 483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  45.3 
 
 		 492 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  44.94 
 
 		 497 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  41.96 
 
 		 530 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  44.5 
 
 		 702 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  44.25 
 
 		 908 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  44.94 
 
 		 497 aa  335  7e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  44.29 
 
 		 496 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  44.29 
 
 		 496 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  44.47 
 
 		 489 aa  333  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  44.9 
 
 		 489 aa  332  7.000000000000001e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  44.42 
 
 		 489 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  44.42 
 
 		 489 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  44.42 
 
 		 489 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  44.42 
 
 		 489 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  44.42 
 
 		 489 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  44.17 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  44.17 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  44.17 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  44.17 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  44.17 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  44.17 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  42.58 
 
 		 490 aa  331  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  44.17 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  44.17 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  45.54 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  45.61 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  43.96 
 
 		 1093 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  45.54 
 
 		 485 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  44.58 
 
 		 485 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  42.7 
 
 		 636 aa  329  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  45.43 
 
 		 493 aa  329  7e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  44.42 
 
 		 489 aa  329  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  44.34 
 
 		 485 aa  328  8e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  44.07 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  44.07 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  44.31 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  44.34 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  44.07 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  44.34 
 
 		 485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  44.82 
 
 		 485 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  45.26 
 
 		 487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  43.95 
 
 		 474 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  41.36 
 
 		 483 aa  327  3e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  44.34 
 
 		 485 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  43.77 
 
 		 990 aa  326  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  44.1 
 
 		 485 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  44.14 
 
 		 507 aa  326  6e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  43.93 
 
 		 489 aa  325  7e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  43.93 
 
 		 489 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  44.55 
 
 		 503 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  43.5 
 
 		 1040 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  44.1 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  41.01 
 
 		 543 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  43.34 
 
 		 1080 aa  324  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  44.72 
 
 		 1427 aa  323  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  43.6 
 
 		 1123 aa  323  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  43.24 
 
 		 922 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  44.66 
 
 		 484 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  43.93 
 
 		 1194 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  44.17 
 
 		 502 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  44.17 
 
 		 488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  44.42 
 
 		 502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  43.73 
 
 		 1041 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  43.03 
 
 		 974 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  44.47 
 
 		 490 aa  318  9e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  43.69 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  41.83 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  43.93 
 
 		 502 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  43.93 
 
 		 502 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  39.48 
 
 		 515 aa  318  2e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  44.08 
 
 		 495 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  43.45 
 
 		 489 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  38.55 
 
 		 525 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2112  ribonuclease G  45.87 
 
 		 483 aa  317  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  43.45 
 
 		 502 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  44.89 
 
 		 493 aa  316  5e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  41.5 
 
 		 485 aa  315  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>