More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1194 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  90.18 
 
 		 489 aa  899    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  90.18 
 
 		 489 aa  899    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  90.18 
 
 		 489 aa  899    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  89.98 
 
 		 489 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4398  ribonuclease G  70.84 
 
 		 500 aa  690    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  100 
 
 		 489 aa  1004    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  92.43 
 
 		 489 aa  915    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  71.78 
 
 		 502 aa  723    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  68.1 
 
 		 485 aa  691    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  70.96 
 
 		 488 aa  715    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  90.18 
 
 		 489 aa  899    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  71.87 
 
 		 500 aa  706    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  100 
 
 		 489 aa  1004    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  78.32 
 
 		 489 aa  761    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  90.18 
 
 		 489 aa  899    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  89.98 
 
 		 489 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0562  ribonuclease G  70.84 
 
 		 500 aa  691    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.229601  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  70.96 
 
 		 488 aa  711    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  89.98 
 
 		 489 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  71.57 
 
 		 488 aa  729    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  79.96 
 
 		 489 aa  801    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  91.62 
 
 		 489 aa  907    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  92.02 
 
 		 489 aa  909    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  90.18 
 
 		 489 aa  899    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3330  ribonuclease G  71.05 
 
 		 496 aa  710    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  90.18 
 
 		 489 aa  899    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  90.18 
 
 		 489 aa  899    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  70.35 
 
 		 487 aa  726    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  79.75 
 
 		 489 aa  799    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  71.57 
 
 		 491 aa  712    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  71.17 
 
 		 502 aa  716    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  71.37 
 
 		 488 aa  717    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  90.39 
 
 		 489 aa  895    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3734  ribonuclease G  71.19 
 
 		 496 aa  706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  70.96 
 
 		 502 aa  713    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  89.98 
 
 		 489 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  70.96 
 
 		 488 aa  711    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  70.96 
 
 		 502 aa  711    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  71.17 
 
 		 502 aa  716    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  100 
 
 		 489 aa  1004    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  80.57 
 
 		 489 aa  802    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  92.84 
 
 		 489 aa  914    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  72.48 
 
 		 502 aa  719    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  89.98 
 
 		 489 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1126  ribonuclease G  71.49 
 
 		 491 aa  709    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0361848  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  71.87 
 
 		 502 aa  706    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  91.82 
 
 		 489 aa  909    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  56.71 
 
 		 492 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  54.23 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  54.23 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  57.29 
 
 		 485 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  54.95 
 
 		 492 aa  558  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  57.29 
 
 		 485 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  57.17 
 
 		 493 aa  559  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  57.72 
 
 		 490 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  58.3 
 
 		 493 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  54.18 
 
 		 489 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1989  ribonuclease, Rne/Rng family  58.28 
 
 		 504 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  54.18 
 
 		 489 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  56.68 
 
 		 492 aa  551  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  54.18 
 
 		 489 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  56.28 
 
 		 485 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  56.88 
 
 		 485 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  56.88 
 
 		 487 aa  548  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  56.28 
 
 		 485 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  55.67 
 
 		 485 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  52.95 
 
 		 483 aa  547  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  56.07 
 
 		 485 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  56.28 
 
 		 485 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  56.48 
 
 		 485 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  55.47 
 
 		 485 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  54.99 
 
 		 484 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  54.53 
 
 		 497 aa  535  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  54.71 
 
 		 496 aa  535  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  54.1 
 
 		 490 aa  535  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  54.75 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0379  ribonuclease G  56.82 
 
 		 484 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1891  ribonuclease G  55.19 
 
 		 488 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  54.12 
 
 		 497 aa  531  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1068  ribonuclease G  55.19 
 
 		 488 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.112502  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0351  ribonuclease  55.19 
 
 		 488 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0799  ribonuclease G  55.19 
 
 		 488 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2218  ribonuclease  54.58 
 
 		 489 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.513685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1377  ribonuclease G  54.99 
 
 		 488 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.231093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5628  ribonuclease G  54.58 
 
 		 489 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1008  ribonuclease G  54.99 
 
 		 508 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1233  ribonuclease  54.99 
 
 		 488 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2339  ribonuclease  54.58 
 
 		 489 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0414308  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1224  ribonuclease  54.99 
 
 		 488 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  55.91 
 
 		 499 aa  525  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0977  ribonuclease  54.67 
 
 		 490 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1689  ribonuclease  54.58 
 
 		 489 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.741186  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2324  ribonuclease  54.58 
 
 		 489 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.161969  normal  0.359737 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2301  ribonuclease  54.58 
 
 		 489 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3824  ribonuclease, Rne/Rng family  53.97 
 
 		 484 aa  519  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2529  RNAse G  52.95 
 
 		 486 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  50.3 
 
 		 495 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  50.1 
 
 		 495 aa  510  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2137  ribonuclease  55.83 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0778  RNAse G  52.75 
 
 		 510 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>