More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1375 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  100 
 
 		 483 aa  991    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  38.13 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  38.13 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  39.47 
 
 		 497 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  41.91 
 
 		 564 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  39.27 
 
 		 497 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  39.72 
 
 		 503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  39.11 
 
 		 530 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  40.89 
 
 		 559 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  37.83 
 
 		 492 aa  350  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  42.24 
 
 		 503 aa  350  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  39.31 
 
 		 494 aa  350  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  38.43 
 
 		 490 aa  349  7e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  37.22 
 
 		 492 aa  349  8e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  43.17 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  40.93 
 
 		 562 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  42.45 
 
 		 496 aa  346  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  37.07 
 
 		 487 aa  342  9e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  41.79 
 
 		 496 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  36.42 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  37.07 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  38.36 
 
 		 636 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  36.42 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  37.13 
 
 		 543 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  36.42 
 
 		 489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  38.9 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  38.7 
 
 		 489 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  39.23 
 
 		 495 aa  337  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  39.18 
 
 		 491 aa  336  5.999999999999999e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  38.7 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  38.29 
 
 		 489 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  38.57 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  39.5 
 
 		 485 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  36.76 
 
 		 525 aa  334  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  40.18 
 
 		 571 aa  334  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  37.33 
 
 		 499 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  37.14 
 
 		 491 aa  334  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  38.88 
 
 		 485 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  39.09 
 
 		 485 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  39.29 
 
 		 515 aa  330  4e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  38.1 
 
 		 499 aa  330  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  38.49 
 
 		 489 aa  330  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  38.46 
 
 		 485 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  38.46 
 
 		 485 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  38.46 
 
 		 485 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  38.09 
 
 		 489 aa  329  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  41.81 
 
 		 503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  37.47 
 
 		 492 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  38.25 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  37.68 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  37.88 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  37.88 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  37.47 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  38.05 
 
 		 485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  37.88 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  38.24 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  37.88 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  36.18 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  37.88 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  37.88 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  37.88 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  37.47 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  37.47 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  37.47 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  37.88 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  37.47 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  38.05 
 
 		 512 aa  326  7e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  40.76 
 
 		 507 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  36.99 
 
 		 496 aa  325  9e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  37.92 
 
 		 484 aa  325  9e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  41.87 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  38.29 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  38.29 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  38.29 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  37.84 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  37.84 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  37.27 
 
 		 493 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  37.37 
 
 		 490 aa  324  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  35.32 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  36.98 
 
 		 537 aa  323  5e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  36.36 
 
 		 495 aa  322  6e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  36.16 
 
 		 495 aa  322  8e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  36.55 
 
 		 497 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  34.58 
 
 		 483 aa  322  9.000000000000001e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1126  ribonuclease G  37.6 
 
 		 491 aa  322  9.000000000000001e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0361848  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  35.96 
 
 		 515 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2529  RNAse G  37.89 
 
 		 486 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2137  ribonuclease  38.2 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2112  ribonuclease G  38.75 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0778  RNAse G  37.3 
 
 		 510 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3824  ribonuclease, Rne/Rng family  37.19 
 
 		 484 aa  319  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5628  ribonuclease G  37.04 
 
 		 489 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2324  ribonuclease  37.04 
 
 		 489 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.161969  normal  0.359737 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1689  ribonuclease  37.04 
 
 		 489 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.741186  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2301  ribonuclease  37.04 
 
 		 489 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1989  ribonuclease, Rne/Rng family  37.07 
 
 		 504 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  37.5 
 
 		 502 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1008  ribonuclease G  36.91 
 
 		 508 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0799  ribonuclease G  36.7 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1068  ribonuclease G  36.7 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.112502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>