More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4468 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  91.34 
 
 		 485 aa  879    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  100 
 
 		 485 aa  982    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  68.83 
 
 		 493 aa  664    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  99.59 
 
 		 485 aa  979    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  95.05 
 
 		 492 aa  915    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  91.13 
 
 		 485 aa  879    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  87.63 
 
 		 485 aa  846    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  91.34 
 
 		 485 aa  880    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  65.85 
 
 		 492 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  68.31 
 
 		 484 aa  654    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  69.4 
 
 		 487 aa  663    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  89.9 
 
 		 485 aa  857    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  91.34 
 
 		 485 aa  884    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  88.04 
 
 		 485 aa  848    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  91.55 
 
 		 485 aa  881    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  63.08 
 
 		 490 aa  618  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  62.96 
 
 		 493 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  59.31 
 
 		 487 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  58.85 
 
 		 483 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  58.79 
 
 		 492 aa  586  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1989  ribonuclease, Rne/Rng family  60.76 
 
 		 504 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  58.48 
 
 		 497 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0379  ribonuclease G  62.01 
 
 		 484 aa  579  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  58.48 
 
 		 497 aa  581  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  60.44 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  57.52 
 
 		 496 aa  578  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  57.52 
 
 		 496 aa  578  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  59.92 
 
 		 488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  58.93 
 
 		 490 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  56.59 
 
 		 489 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  58.92 
 
 		 495 aa  574  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  56.39 
 
 		 489 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  57 
 
 		 485 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3824  ribonuclease, Rne/Rng family  59.96 
 
 		 484 aa  565  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  57.26 
 
 		 496 aa  567  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  56.39 
 
 		 489 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  58.5 
 
 		 489 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  58.3 
 
 		 489 aa  558  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  57.09 
 
 		 489 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  57.09 
 
 		 489 aa  555  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  58.11 
 
 		 483 aa  554  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  57.89 
 
 		 489 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  56.07 
 
 		 489 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  56.07 
 
 		 489 aa  548  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  56.07 
 
 		 489 aa  548  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  56.48 
 
 		 489 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  56.48 
 
 		 489 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  56.07 
 
 		 489 aa  548  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  56.48 
 
 		 489 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  56.07 
 
 		 489 aa  548  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  56.07 
 
 		 489 aa  548  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  56.48 
 
 		 489 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  58.3 
 
 		 488 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  56.07 
 
 		 489 aa  548  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  56.07 
 
 		 489 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  56.48 
 
 		 489 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  57.89 
 
 		 488 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  57.09 
 
 		 489 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  58.5 
 
 		 489 aa  547  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2137  ribonuclease  61.08 
 
 		 482 aa  545  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  56.07 
 
 		 489 aa  545  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  58.1 
 
 		 502 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  58.1 
 
 		 502 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  56.28 
 
 		 489 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1891  ribonuclease G  56.82 
 
 		 488 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1224  ribonuclease  57.03 
 
 		 488 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1377  ribonuclease G  57.03 
 
 		 488 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.231093  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  57.09 
 
 		 502 aa  541  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  55.87 
 
 		 489 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  57.69 
 
 		 502 aa  544  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0799  ribonuclease G  56.82 
 
 		 488 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0351  ribonuclease  56.82 
 
 		 488 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  56.28 
 
 		 489 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1233  ribonuclease  57.03 
 
 		 488 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1068  ribonuclease G  56.82 
 
 		 488 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.112502  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  56.28 
 
 		 489 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4398  ribonuclease G  57.49 
 
 		 500 aa  541  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  57.09 
 
 		 502 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  57.09 
 
 		 488 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5628  ribonuclease G  56.3 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1008  ribonuclease G  57.43 
 
 		 508 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2324  ribonuclease  56.3 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.161969  normal  0.359737 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1689  ribonuclease  56.3 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.741186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  57.09 
 
 		 502 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2301  ribonuclease  56.3 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  57.09 
 
 		 488 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0977  ribonuclease  56.39 
 
 		 490 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2218  ribonuclease  56.1 
 
 		 489 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.513685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  55.47 
 
 		 489 aa  537  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0364  ribonuclease  55.85 
 
 		 483 aa  536  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2339  ribonuclease  56.1 
 
 		 489 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0414308  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  57.09 
 
 		 500 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2197  ribonuclease G  55.89 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1995  ribonuclease, Rne/Rng family  55.89 
 
 		 489 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422302  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  55.31 
 
 		 495 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2622  ribonuclease  54.84 
 
 		 495 aa  531  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134326  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  54.91 
 
 		 495 aa  532  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3330  ribonuclease G  56.01 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0562  ribonuclease G  56.88 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.229601  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2395  ribonuclease, Rne/Rng family  55.69 
 
 		 489 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>