More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1546 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  74.07 
 
 		 1427 aa  766    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  68.09 
 
 		 1040 aa  715    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  69.22 
 
 		 1058 aa  710    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  76.52 
 
 		 1265 aa  771    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  64.45 
 
 		 987 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  74.69 
 
 		 952 aa  732    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  69.25 
 
 		 1024 aa  711    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  70.74 
 
 		 717 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  75.48 
 
 		 944 aa  737    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  80.93 
 
 		 908 aa  807    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  64.09 
 
 		 953 aa  636    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  75.21 
 
 		 1151 aa  759    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  64.47 
 
 		 1016 aa  655    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  72.94 
 
 		 959 aa  679    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 1041 aa  2050    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  66.84 
 
 		 1093 aa  744    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  83.16 
 
 		 990 aa  830    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  76.79 
 
 		 1194 aa  763    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  71.4 
 
 		 1080 aa  692    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  75.58 
 
 		 1048 aa  714    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  71.77 
 
 		 1007 aa  809    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  72.18 
 
 		 974 aa  735    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  75.58 
 
 		 1334 aa  810    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  64.45 
 
 		 991 aa  661    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  78.73 
 
 		 922 aa  831    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  75.97 
 
 		 1018 aa  724    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  78.33 
 
 		 1117 aa  761    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  71.81 
 
 		 1091 aa  715    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  75.83 
 
 		 1113 aa  759    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  74.69 
 
 		 702 aa  731    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  73.51 
 
 		 1070 aa  704    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  64.45 
 
 		 991 aa  661    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  76.34 
 
 		 1043 aa  734    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  63.64 
 
 		 961 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  62.93 
 
 		 1022 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  61.85 
 
 		 1093 aa  598  1e-169  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  59.28 
 
 		 1244 aa  564  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  49.76 
 
 		 457 aa  403  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  46.44 
 
 		 559 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  39.79 
 
 		 494 aa  349  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  45.21 
 
 		 564 aa  347  8e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  45.89 
 
 		 562 aa  342  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  45.94 
 
 		 636 aa  339  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  42.75 
 
 		 492 aa  335  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  43.26 
 
 		 531 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  41.67 
 
 		 496 aa  325  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  41.67 
 
 		 496 aa  325  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  41.71 
 
 		 503 aa  324  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  41.84 
 
 		 503 aa  323  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  43.27 
 
 		 496 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  43.27 
 
 		 496 aa  320  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  47.62 
 
 		 485 aa  318  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  42.79 
 
 		 500 aa  318  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  47.62 
 
 		 485 aa  317  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  47.62 
 
 		 485 aa  317  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  38.08 
 
 		 543 aa  317  8e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  43.8 
 
 		 411 aa  317  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  42.54 
 
 		 489 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  45.75 
 
 		 485 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  42.54 
 
 		 489 aa  314  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  42.54 
 
 		 489 aa  314  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  43.36 
 
 		 497 aa  314  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  43.36 
 
 		 497 aa  313  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  45.5 
 
 		 485 aa  313  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  41.79 
 
 		 483 aa  313  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  44.09 
 
 		 497 aa  312  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  46.37 
 
 		 492 aa  312  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  46.62 
 
 		 485 aa  311  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  44.72 
 
 		 571 aa  310  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  45.39 
 
 		 490 aa  310  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  43.07 
 
 		 491 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  40.23 
 
 		 530 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  45.07 
 
 		 485 aa  307  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  42.93 
 
 		 492 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  45.07 
 
 		 485 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  41.11 
 
 		 501 aa  306  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  41.85 
 
 		 499 aa  305  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  43 
 
 		 490 aa  304  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  38.11 
 
 		 1056 aa  304  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  39.58 
 
 		 517 aa  304  6.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  37.74 
 
 		 1074 aa  303  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  44.33 
 
 		 485 aa  302  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  45.61 
 
 		 485 aa  302  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1720  ribonuclease  39.09 
 
 		 1007 aa  302  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  38.16 
 
 		 1076 aa  302  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  41.77 
 
 		 495 aa  302  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  41.77 
 
 		 495 aa  301  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  38.11 
 
 		 938 aa  301  4e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  38.11 
 
 		 1035 aa  301  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  43 
 
 		 489 aa  300  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1593  ribonuclease  36.74 
 
 		 1128 aa  299  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  42.75 
 
 		 489 aa  299  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  39.39 
 
 		 508 aa  299  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  37.56 
 
 		 1071 aa  299  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  43.61 
 
 		 484 aa  298  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  43.72 
 
 		 499 aa  298  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  40.1 
 
 		 476 aa  298  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  38.04 
 
 		 528 aa  298  4e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  37.56 
 
 		 1132 aa  298  4e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2302  ribonuclease  36.5 
 
 		 1102 aa  298  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>