More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3551 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  64.48 
 
 
1058 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  65.47 
 
 
1123 aa  793    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  67.54 
 
 
944 aa  669    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  62.85 
 
 
952 aa  677    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  66.15 
 
 
1080 aa  663    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  65.75 
 
 
990 aa  664    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  64.45 
 
 
1041 aa  662    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  64.85 
 
 
1334 aa  706    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  73.42 
 
 
1016 aa  1041    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  64.91 
 
 
1043 aa  688    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  99.77 
 
 
987 aa  1533    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  65.84 
 
 
1117 aa  690    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  63.47 
 
 
1024 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  63.65 
 
 
1265 aa  689    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  69.25 
 
 
953 aa  993    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  68.13 
 
 
1194 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  100 
 
 
991 aa  1939    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  64.53 
 
 
1151 aa  670    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  65.43 
 
 
1427 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  55.59 
 
 
1093 aa  714    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  66.67 
 
 
1018 aa  640    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  58.04 
 
 
1040 aa  849    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  100 
 
 
991 aa  1939    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  63.71 
 
 
1091 aa  651    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  67.59 
 
 
922 aa  657    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  60.03 
 
 
1113 aa  687    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  64.64 
 
 
1007 aa  646    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  67.47 
 
 
974 aa  730    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  76.33 
 
 
961 aa  1115    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  65.42 
 
 
1070 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  64.05 
 
 
908 aa  627  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  66.94 
 
 
1244 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  59.29 
 
 
702 aa  621  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  60.41 
 
 
717 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  57.37 
 
 
1022 aa  562  1e-158  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  59.33 
 
 
1093 aa  559  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  47.94 
 
 
457 aa  376  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  41.97 
 
 
564 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  41.18 
 
 
483 aa  303  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  41.89 
 
 
559 aa  302  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  42.05 
 
 
636 aa  297  8e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  39.57 
 
 
492 aa  296  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  41.75 
 
 
571 aa  293  9e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  39.82 
 
 
543 aa  293  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  38.66 
 
 
494 aa  291  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  39 
 
 
562 aa  290  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  43.34 
 
 
485 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  43.96 
 
 
485 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  41.42 
 
 
483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  38.43 
 
 
503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  42.89 
 
 
490 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  40.73 
 
 
411 aa  285  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  37.85 
 
 
496 aa  284  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  37.85 
 
 
496 aa  284  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  41.29 
 
 
492 aa  283  9e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1619  RNAse E  40.87 
 
 
968 aa  280  9e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000868095  normal  0.696665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  39.86 
 
 
489 aa  280  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  40.52 
 
 
497 aa  279  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  39.12 
 
 
1074 aa  278  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  41.38 
 
 
416 aa  278  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  40 
 
 
1057 aa  278  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  38.61 
 
 
491 aa  277  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  40.19 
 
 
531 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  39.39 
 
 
496 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  38.68 
 
 
499 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  39.71 
 
 
489 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  39.71 
 
 
489 aa  275  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  39.19 
 
 
496 aa  275  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  40.41 
 
 
1012 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  40 
 
 
1073 aa  274  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  41.46 
 
 
496 aa  273  9e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  39.23 
 
 
490 aa  273  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1593  ribonuclease  38.54 
 
 
1128 aa  272  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4788  ribonuclease  38.6 
 
 
1038 aa  271  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.870424  normal  0.38307 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  36.08 
 
 
528 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  38.43 
 
 
503 aa  272  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  39.15 
 
 
496 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  40 
 
 
1139 aa  272  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002988  ribonuclease E  39.8 
 
 
1024 aa  271  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5282  ribonuclease  38.34 
 
 
1044 aa  270  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0972122  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  37.14 
 
 
1076 aa  270  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  39.22 
 
 
1128 aa  270  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  38.34 
 
 
1053 aa  270  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  37.56 
 
 
501 aa  270  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  38.34 
 
 
1059 aa  270  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  39.55 
 
 
1035 aa  269  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  40 
 
 
1072 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  39.22 
 
 
1082 aa  269  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  38.48 
 
 
495 aa  269  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  38.86 
 
 
517 aa  269  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1720  ribonuclease  39.38 
 
 
1007 aa  269  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  38.92 
 
 
1056 aa  269  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  38.96 
 
 
1120 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  36.3 
 
 
528 aa  268  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2785  ribonuclease E  38.54 
 
 
1088 aa  268  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  38.72 
 
 
495 aa  268  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2504  ribonuclease  38.29 
 
 
1084 aa  268  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  36.41 
 
 
487 aa  268  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0818  ribonuclease  38.86 
 
 
1092 aa  268  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00158382  normal  0.513461 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2193  ribonuclease  38.34 
 
 
1111 aa  268  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695078  normal  0.0536966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>