More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3947 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  63.64 
 
 		 1041 aa  651    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  61.73 
 
 		 1151 aa  659    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  63.4 
 
 		 1265 aa  687    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  62.17 
 
 		 1024 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  66.93 
 
 		 1334 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  64.24 
 
 		 990 aa  648    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  64.02 
 
 		 1058 aa  641    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  67.65 
 
 		 1018 aa  643    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  64.34 
 
 		 1427 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  64.04 
 
 		 1093 aa  725    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  76.01 
 
 		 987 aa  1111    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  71.91 
 
 		 953 aa  970    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  66.8 
 
 		 922 aa  657    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  62.86 
 
 		 952 aa  678    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  64.58 
 
 		 1091 aa  649    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  68.61 
 
 		 1040 aa  803    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  100 
 
 		 961 aa  1893    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  63.55 
 
 		 1043 aa  680    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  67.8 
 
 		 1194 aa  681    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  64.34 
 
 		 1123 aa  803    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  78.24 
 
 		 1016 aa  1167    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  65.77 
 
 		 1117 aa  680    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  62.86 
 
 		 1080 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  76.36 
 
 		 991 aa  1111    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  70.43 
 
 		 1048 aa  667    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  59.31 
 
 		 1113 aa  669    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  62.12 
 
 		 1007 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  76.36 
 
 		 991 aa  1111    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  66.04 
 
 		 908 aa  624  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  66.87 
 
 		 1244 aa  625  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  64.42 
 
 		 959 aa  622  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  56.8 
 
 		 1070 aa  621  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  58.86 
 
 		 702 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  58.44 
 
 		 717 aa  596  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  53.78 
 
 		 1093 aa  551  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  57.61 
 
 		 1022 aa  548  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  47.48 
 
 		 457 aa  375  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  41.93 
 
 		 559 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  41.67 
 
 		 564 aa  300  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  42.43 
 
 		 636 aa  299  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  40.74 
 
 		 483 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  38.65 
 
 		 492 aa  291  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  38.94 
 
 		 543 aa  291  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  41.3 
 
 		 571 aa  290  9e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  39.14 
 
 		 562 aa  289  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  39.18 
 
 		 494 aa  290  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  41.94 
 
 		 416 aa  283  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  40.99 
 
 		 483 aa  281  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  40.1 
 
 		 492 aa  280  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  39.36 
 
 		 411 aa  278  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  41.95 
 
 		 490 aa  278  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  37.9 
 
 		 503 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  39.02 
 
 		 489 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  40.98 
 
 		 485 aa  274  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  37.08 
 
 		 496 aa  274  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  37.08 
 
 		 496 aa  274  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  39.29 
 
 		 1057 aa  274  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  39.76 
 
 		 531 aa  273  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  41.61 
 
 		 485 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  39.25 
 
 		 497 aa  272  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  38 
 
 		 499 aa  272  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  39.57 
 
 		 496 aa  271  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  39.37 
 
 		 1074 aa  270  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  38.54 
 
 		 489 aa  270  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  38.54 
 
 		 489 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  39.44 
 
 		 1012 aa  270  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  39.79 
 
 		 1073 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5282  ribonuclease  39.11 
 
 		 1044 aa  268  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0972122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  36.96 
 
 		 491 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  39.57 
 
 		 496 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  38.3 
 
 		 503 aa  268  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  34.86 
 
 		 476 aa  268  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  39.31 
 
 		 938 aa  268  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  40.79 
 
 		 496 aa  268  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  36.52 
 
 		 1056 aa  267  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4788  ribonuclease  38.85 
 
 		 1038 aa  267  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.870424  normal  0.38307 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  37.98 
 
 		 496 aa  266  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  40.93 
 
 		 485 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  38.24 
 
 		 490 aa  265  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  38.37 
 
 		 497 aa  266  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  36.64 
 
 		 501 aa  266  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2436  ribonuclease, Rne/Rng family  38.86 
 
 		 1061 aa  266  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  38.58 
 
 		 1073 aa  266  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  40.93 
 
 		 485 aa  265  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  40.93 
 
 		 485 aa  265  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  38.37 
 
 		 497 aa  264  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  39.27 
 
 		 1139 aa  265  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  38.61 
 
 		 808 aa  264  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1720  ribonuclease  39.9 
 
 		 1007 aa  264  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  36.19 
 
 		 487 aa  264  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  38.74 
 
 		 1128 aa  263  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  36.67 
 
 		 1076 aa  264  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  39.53 
 
 		 1072 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  40.93 
 
 		 485 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  40.44 
 
 		 492 aa  263  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  37.74 
 
 		 517 aa  263  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2643  ribonuclease, Rne/Rng family  39.37 
 
 		 1029 aa  263  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1619  RNAse E  39.9 
 
 		 968 aa  263  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000868095  normal  0.696665 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3290  ribonuclease E  39.37 
 
 		 1025 aa  263  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  36.13 
 
 		 866 aa  263  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>