More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1614 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  100 
 
 		 476 aa  958    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  37.66 
 
 		 562 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  37.61 
 
 		 559 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  37.47 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  38.81 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  36.44 
 
 		 564 aa  325  9e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  38.06 
 
 		 531 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  38.83 
 
 		 411 aa  316  7e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  36.9 
 
 		 483 aa  315  1.9999999999999998e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  36.93 
 
 		 492 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  40.15 
 
 		 1427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  37.83 
 
 		 487 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  40.9 
 
 		 1194 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  40.93 
 
 		 908 aa  309  8e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  35.65 
 
 		 492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  35.26 
 
 		 503 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  38.17 
 
 		 702 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  38.71 
 
 		 500 aa  307  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  33.6 
 
 		 496 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  33.6 
 
 		 496 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  36.46 
 
 		 493 aa  306  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  36.82 
 
 		 488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  35.42 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  41.75 
 
 		 485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  37.61 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  35.55 
 
 		 517 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  38.89 
 
 		 1080 aa  303  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  37.09 
 
 		 496 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  37.32 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2112  ribonuclease G  38.12 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  39.17 
 
 		 922 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  39.75 
 
 		 990 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  40.35 
 
 		 1041 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  37.09 
 
 		 496 aa  300  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  39.9 
 
 		 1334 aa  300  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  38.55 
 
 		 489 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  38.55 
 
 		 489 aa  299  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  41.27 
 
 		 485 aa  299  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  34.13 
 
 		 543 aa  299  8e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  41.77 
 
 		 571 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  39.75 
 
 		 974 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  34.95 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  39.45 
 
 		 1091 aa  298  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  40.1 
 
 		 1007 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  40.8 
 
 		 485 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  40.8 
 
 		 485 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  40.8 
 
 		 485 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  36.53 
 
 		 489 aa  297  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  40.8 
 
 		 485 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  37.69 
 
 		 485 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  34.24 
 
 		 530 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  37.69 
 
 		 485 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  38.95 
 
 		 490 aa  296  7e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  39.66 
 
 		 1070 aa  295  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  40.57 
 
 		 492 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  35.09 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  34.49 
 
 		 487 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  39.15 
 
 		 1113 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  36.12 
 
 		 489 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  36.79 
 
 		 525 aa  294  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  36.12 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  36.57 
 
 		 502 aa  294  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  38.71 
 
 		 1093 aa  294  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  38.52 
 
 		 1048 aa  293  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  38.27 
 
 		 952 aa  292  8e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  39.15 
 
 		 1151 aa  292  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  39.3 
 
 		 1058 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  33.6 
 
 		 497 aa  292  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  39.07 
 
 		 474 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  33.6 
 
 		 497 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  36.48 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  35.61 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  36.21 
 
 		 502 aa  290  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  40.09 
 
 		 485 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  36.21 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  36.21 
 
 		 502 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  37.91 
 
 		 493 aa  289  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  38.37 
 
 		 959 aa  289  7e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  34.94 
 
 		 489 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  34.94 
 
 		 489 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  34.94 
 
 		 489 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  34.94 
 
 		 489 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  34.94 
 
 		 489 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  34.31 
 
 		 489 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  34.31 
 
 		 489 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  35.15 
 
 		 489 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  39.86 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  36.21 
 
 		 488 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  34.31 
 
 		 489 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  34.31 
 
 		 489 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  38.77 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  36.21 
 
 		 488 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  34.31 
 
 		 489 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  34.31 
 
 		 489 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  34.31 
 
 		 489 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  36.21 
 
 		 502 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  34.31 
 
 		 489 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  39.05 
 
 		 1024 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  36.01 
 
 		 502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  36.01 
 
 		 502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>