More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3188 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  66.26 
 
 		 492 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  100 
 
 		 492 aa  1001    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  65.52 
 
 		 487 aa  642    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  66.53 
 
 		 485 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  67.95 
 
 		 485 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  66.8 
 
 		 485 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  67 
 
 		 485 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  66.87 
 
 		 493 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  65.59 
 
 		 485 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  66.33 
 
 		 485 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  66.33 
 
 		 485 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  65.85 
 
 		 485 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  65.65 
 
 		 485 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  65.17 
 
 		 484 aa  626  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  65.04 
 
 		 485 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  60.08 
 
 		 492 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  61.97 
 
 		 493 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  60.4 
 
 		 490 aa  592  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0379  ribonuclease G  61.05 
 
 		 484 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  54.75 
 
 		 487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  56.77 
 
 		 496 aa  571  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  56.77 
 
 		 496 aa  571  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  55.56 
 
 		 488 aa  566  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  56.91 
 
 		 496 aa  566  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1989  ribonuclease, Rne/Rng family  58.82 
 
 		 504 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  56.44 
 
 		 490 aa  559  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  53.94 
 
 		 489 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  54.75 
 
 		 489 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  54.75 
 
 		 489 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  52.85 
 
 		 483 aa  545  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  52.93 
 
 		 485 aa  544  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2137  ribonuclease  60.37 
 
 		 482 aa  545  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  53.49 
 
 		 497 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  55.17 
 
 		 483 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  53.49 
 
 		 497 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  55.15 
 
 		 489 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  54.95 
 
 		 489 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  54.75 
 
 		 489 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  54.55 
 
 		 489 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  53.94 
 
 		 489 aa  535  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  54.55 
 
 		 489 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  54.55 
 
 		 489 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  54.55 
 
 		 489 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  54.75 
 
 		 489 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0977  ribonuclease  54.49 
 
 		 490 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  53.86 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  54.55 
 
 		 489 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  53.94 
 
 		 489 aa  535  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  53.94 
 
 		 489 aa  535  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  54.95 
 
 		 489 aa  534  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2218  ribonuclease  54.6 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.513685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  53.94 
 
 		 489 aa  535  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  54.95 
 
 		 489 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1995  ribonuclease, Rne/Rng family  54.16 
 
 		 489 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422302  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2529  RNAse G  54.88 
 
 		 486 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  53.94 
 
 		 489 aa  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5628  ribonuclease G  54.95 
 
 		 489 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  54.95 
 
 		 489 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  53.94 
 
 		 489 aa  535  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2395  ribonuclease, Rne/Rng family  53.75 
 
 		 489 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  53.94 
 
 		 489 aa  535  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  53.94 
 
 		 489 aa  535  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3824  ribonuclease, Rne/Rng family  56.19 
 
 		 484 aa  535  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0778  RNAse G  54.47 
 
 		 510 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1689  ribonuclease  54.4 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.741186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  53.94 
 
 		 489 aa  535  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  54.75 
 
 		 489 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2339  ribonuclease  54.73 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0414308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2301  ribonuclease  54.4 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2324  ribonuclease  54.4 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.161969  normal  0.359737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  54.55 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2197  ribonuclease G  54.36 
 
 		 489 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1233  ribonuclease  53.86 
 
 		 488 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1377  ribonuclease G  53.86 
 
 		 488 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.231093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  55.03 
 
 		 499 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1008  ribonuclease G  54.67 
 
 		 508 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  54.34 
 
 		 489 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1224  ribonuclease  53.86 
 
 		 488 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  54.23 
 
 		 489 aa  525  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  54.34 
 
 		 489 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1891  ribonuclease G  53.66 
 
 		 488 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0364  ribonuclease  53.64 
 
 		 483 aa  527  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  51.71 
 
 		 495 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1068  ribonuclease G  53.66 
 
 		 488 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.112502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0799  ribonuclease G  53.66 
 
 		 488 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  51.51 
 
 		 495 aa  527  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  53.94 
 
 		 488 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0351  ribonuclease  53.66 
 
 		 488 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  53.94 
 
 		 488 aa  524  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  51.91 
 
 		 491 aa  523  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  50.75 
 
 		 528 aa  521  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  53.74 
 
 		 502 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  53.74 
 
 		 502 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4398  ribonuclease G  54.27 
 
 		 500 aa  519  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  50.38 
 
 		 528 aa  519  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2112  ribonuclease G  54.07 
 
 		 483 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  53.54 
 
 		 502 aa  519  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3734  ribonuclease G  53.86 
 
 		 496 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  53.13 
 
 		 502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1946  ribonuclease  54.88 
 
 		 493 aa  515  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>