More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5498 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 543 aa  1094    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  49.9 
 
 		 503 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  49.7 
 
 		 531 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  48.32 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  48.52 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  47.43 
 
 		 503 aa  465  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  49.51 
 
 		 500 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  50.59 
 
 		 503 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  46.89 
 
 		 530 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  48.14 
 
 		 507 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  46 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  46 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  46.05 
 
 		 489 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  44.34 
 
 		 492 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  46 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  45.26 
 
 		 489 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  45.81 
 
 		 497 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  43.66 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  45.05 
 
 		 490 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  44.47 
 
 		 487 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  44.66 
 
 		 489 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  45.4 
 
 		 489 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  45.21 
 
 		 489 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  45.4 
 
 		 489 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  45.6 
 
 		 489 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  44.86 
 
 		 502 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  45.4 
 
 		 489 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  44.23 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  44.86 
 
 		 489 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  44.86 
 
 		 489 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  44.66 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  44.86 
 
 		 489 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  44.81 
 
 		 489 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  44.86 
 
 		 489 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  44.86 
 
 		 489 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  44.81 
 
 		 489 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  44.86 
 
 		 489 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  44.81 
 
 		 489 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  44.81 
 
 		 489 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  44.81 
 
 		 489 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  44.86 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  44.49 
 
 		 492 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  44.86 
 
 		 489 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  44.86 
 
 		 489 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  45.26 
 
 		 502 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  44.86 
 
 		 489 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  44.96 
 
 		 484 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3330  ribonuclease G  44.86 
 
 		 496 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  45.26 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  44.66 
 
 		 502 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  44.07 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  44.66 
 
 		 502 aa  411  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  45.54 
 
 		 485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4398  ribonuclease G  44.27 
 
 		 500 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  44.23 
 
 		 489 aa  405  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  44.23 
 
 		 489 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  45.4 
 
 		 489 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  45.35 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  44.73 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  43.5 
 
 		 528 aa  402  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  44.38 
 
 		 502 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  41.11 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  44.38 
 
 		 488 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0562  ribonuclease G  44.07 
 
 		 500 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.229601  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  42.19 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  44.18 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  43.88 
 
 		 528 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  44.21 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  43.55 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  44.66 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3734  ribonuclease G  44.27 
 
 		 496 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  44.38 
 
 		 488 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  44.42 
 
 		 489 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  44.77 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  44.64 
 
 		 483 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  43.47 
 
 		 490 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  44.57 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  45.03 
 
 		 495 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  43.95 
 
 		 487 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  42.3 
 
 		 489 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  44.77 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0379  ribonuclease G  44.94 
 
 		 484 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  41.51 
 
 		 508 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  41.91 
 
 		 489 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  44.68 
 
 		 485 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  42.11 
 
 		 489 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  44.77 
 
 		 485 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  45.53 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1126  ribonuclease G  44.29 
 
 		 491 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0361848  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  44.38 
 
 		 485 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  44.77 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  39.61 
 
 		 494 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0731  ribonuclease, Rne/Rng family  49.64 
 
 		 860 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.767786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0732  ribonuclease, Rne/Rng family  49.64 
 
 		 844 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  41.63 
 
 		 501 aa  392  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  41.11 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  44.19 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  44.19 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0696  ribonuclease G  49.39 
 
 		 868 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  41.88 
 
 		 517 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>