More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2393 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  73.58 
 
 		 944 aa  741    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  63.48 
 
 		 1016 aa  649    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  68.04 
 
 		 1265 aa  754    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  73.81 
 
 		 990 aa  729    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  70.2 
 
 		 1043 aa  749    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  73.73 
 
 		 1334 aa  765    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  74.19 
 
 		 1018 aa  708    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  73.81 
 
 		 908 aa  711    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  75.83 
 
 		 1041 aa  740    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  69.58 
 
 		 1007 aa  723    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  67.33 
 
 		 1040 aa  700    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  71.55 
 
 		 1194 aa  707    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  65.75 
 
 		 1151 aa  1199    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  70.44 
 
 		 1024 aa  689    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  67.32 
 
 		 974 aa  741    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  75.11 
 
 		 1048 aa  721    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  60.23 
 
 		 1123 aa  670    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  70.65 
 
 		 1058 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  62.52 
 
 		 991 aa  667    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  72.61 
 
 		 959 aa  675    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  74.23 
 
 		 922 aa  722    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  100 
 
 		 1113 aa  2196    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  79.89 
 
 		 1091 aa  832    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  72.67 
 
 		 702 aa  699    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  70.14 
 
 		 1427 aa  708    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  72.53 
 
 		 1070 aa  722    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  74.48 
 
 		 952 aa  732    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  62.52 
 
 		 987 aa  666    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  62.52 
 
 		 991 aa  667    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  61 
 
 		 961 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  67.86 
 
 		 717 aa  634  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  63.92 
 
 		 953 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  54.42 
 
 		 1093 aa  610  1e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  57.87 
 
 		 1022 aa  612  1e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  65.3 
 
 		 1080 aa  607  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  46.1 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  42.56 
 
 		 636 aa  343  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  42.57 
 
 		 494 aa  328  4.0000000000000003e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  42.52 
 
 		 559 aa  327  9e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  41.3 
 
 		 492 aa  319  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  41.13 
 
 		 564 aa  313  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  40.09 
 
 		 543 aa  310  6.999999999999999e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  45.41 
 
 		 485 aa  307  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  45.66 
 
 		 485 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  42.75 
 
 		 562 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  40.93 
 
 		 503 aa  303  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  39.52 
 
 		 496 aa  302  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  39.52 
 
 		 496 aa  302  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  47.13 
 
 		 485 aa  302  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  41.77 
 
 		 497 aa  301  5e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  41.77 
 
 		 497 aa  300  7e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  41.35 
 
 		 483 aa  298  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  43.41 
 
 		 484 aa  298  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  45.91 
 
 		 485 aa  297  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  45.91 
 
 		 485 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  45.39 
 
 		 492 aa  296  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  41.87 
 
 		 491 aa  296  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  45.91 
 
 		 485 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  40.35 
 
 		 531 aa  295  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  39.15 
 
 		 476 aa  294  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  45.14 
 
 		 485 aa  293  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  41.4 
 
 		 499 aa  293  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  40.62 
 
 		 411 aa  293  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0479  ribonuclease  36.63 
 
 		 1368 aa  292  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  40.7 
 
 		 496 aa  292  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  40.7 
 
 		 496 aa  293  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  38.16 
 
 		 1012 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  44.64 
 
 		 485 aa  290  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  40.14 
 
 		 501 aa  291  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  41.54 
 
 		 489 aa  290  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  39.13 
 
 		 503 aa  290  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  37.17 
 
 		 1076 aa  290  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  40.83 
 
 		 489 aa  289  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  44.39 
 
 		 485 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  40.34 
 
 		 492 aa  289  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  40.32 
 
 		 500 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  41.43 
 
 		 571 aa  288  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  39.17 
 
 		 490 aa  287  9e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  41.29 
 
 		 489 aa  287  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  37.92 
 
 		 1071 aa  287  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  41.25 
 
 		 489 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  43.2 
 
 		 490 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  40.88 
 
 		 497 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  37.05 
 
 		 1082 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  42.07 
 
 		 483 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  41.85 
 
 		 489 aa  285  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0818  ribonuclease  36.82 
 
 		 1092 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00158382  normal  0.513461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  40.63 
 
 		 495 aa  284  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  43.18 
 
 		 485 aa  285  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  37.2 
 
 		 866 aa  284  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.93 
 
 		 1128 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1707  ribonuclease E  39.84 
 
 		 1068 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000337375  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  40.63 
 
 		 495 aa  284  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1814  ribonuclease E  36.58 
 
 		 1087 aa  283  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0112079  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2791  ribonuclease E  36.58 
 
 		 1087 aa  283  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000882056  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  40.39 
 
 		 489 aa  283  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2863  ribonuclease E  36.58 
 
 		 1088 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.829315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2193  ribonuclease  36.28 
 
 		 1111 aa  283  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695078  normal  0.0536966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  40.27 
 
 		 1139 aa  283  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  40.83 
 
 		 489 aa  283  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>