More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1609 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  100 
 
 		 530 aa  1084    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  61.7 
 
 		 531 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  59.96 
 
 		 503 aa  595  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  58 
 
 		 503 aa  592  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  58.8 
 
 		 496 aa  590  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  58.61 
 
 		 496 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  60.74 
 
 		 500 aa  579  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  59.69 
 
 		 503 aa  568  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  59.19 
 
 		 507 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  55.68 
 
 		 517 aa  547  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  46.89 
 
 		 543 aa  467  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  46.91 
 
 		 496 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  46.91 
 
 		 496 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  45.68 
 
 		 497 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  45.68 
 
 		 497 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  46.37 
 
 		 485 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  47.87 
 
 		 489 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  44.02 
 
 		 483 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  45.02 
 
 		 492 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  47.32 
 
 		 492 aa  458  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  46.18 
 
 		 485 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  47.05 
 
 		 493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  46.63 
 
 		 484 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  47.87 
 
 		 489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  44.59 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  45.42 
 
 		 485 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  44.4 
 
 		 489 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  44.4 
 
 		 489 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0738  ribonuclease  57.87 
 
 		 740 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  47.48 
 
 		 489 aa  450  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  45.09 
 
 		 564 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  44.95 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0731  ribonuclease, Rne/Rng family  57.61 
 
 		 860 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.767786  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  47.02 
 
 		 490 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0696  ribonuclease G  56.72 
 
 		 868 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  46.95 
 
 		 487 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0732  ribonuclease, Rne/Rng family  57.61 
 
 		 844 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  45.42 
 
 		 485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  44.77 
 
 		 485 aa  443  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  45.14 
 
 		 492 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  47.32 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  44.51 
 
 		 487 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  45.49 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  42.72 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  44.76 
 
 		 485 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  44.76 
 
 		 485 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  45.28 
 
 		 488 aa  433  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  45.93 
 
 		 489 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  43.24 
 
 		 495 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  45.93 
 
 		 489 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1989  ribonuclease, Rne/Rng family  47.98 
 
 		 504 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  45.21 
 
 		 499 aa  432  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  45.93 
 
 		 489 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  45.93 
 
 		 489 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  47.78 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  45.93 
 
 		 489 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  45.54 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  45.54 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  45.54 
 
 		 489 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2324  ribonuclease  44.4 
 
 		 489 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.161969  normal  0.359737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0379  ribonuclease G  46.83 
 
 		 484 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  45.54 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  43.05 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1891  ribonuclease G  44.89 
 
 		 488 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  45.54 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  45.54 
 
 		 489 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1377  ribonuclease G  44.89 
 
 		 488 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.231093  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  45.54 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0799  ribonuclease G  44.89 
 
 		 488 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  45.54 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2218  ribonuclease  44.59 
 
 		 489 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.513685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  45.54 
 
 		 489 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1068  ribonuclease G  44.89 
 
 		 488 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.112502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  45.54 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1689  ribonuclease  44.4 
 
 		 489 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.741186  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2137  ribonuclease  47.22 
 
 		 482 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0351  ribonuclease  44.89 
 
 		 488 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1233  ribonuclease  44.89 
 
 		 488 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  45.54 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1224  ribonuclease  44.89 
 
 		 488 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2339  ribonuclease  44.79 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0414308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2301  ribonuclease  44.4 
 
 		 489 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  45.01 
 
 		 485 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  46.32 
 
 		 488 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0977  ribonuclease  44.4 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2529  RNAse G  44.02 
 
 		 486 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  44.34 
 
 		 483 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  44.91 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  44.91 
 
 		 485 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5628  ribonuclease G  44.59 
 
 		 489 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  44.91 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1126  ribonuclease G  46.82 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0361848  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  44 
 
 		 496 aa  423  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  46.71 
 
 		 502 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  45.35 
 
 		 489 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  45.35 
 
 		 489 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  46.51 
 
 		 488 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  46.32 
 
 		 489 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  45.16 
 
 		 489 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  46.12 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>