More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1587 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  75.27 
 
 		 1007 aa  711    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  73.37 
 
 		 1043 aa  735    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  76.46 
 
 		 974 aa  757    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  72.15 
 
 		 1427 aa  774    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  72.65 
 
 		 1080 aa  676    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  68.68 
 
 		 922 aa  720    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  58.52 
 
 		 1123 aa  682    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  68.12 
 
 		 944 aa  707    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  68.16 
 
 		 961 aa  677    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  73.53 
 
 		 908 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  77.04 
 
 		 1093 aa  766    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  73.33 
 
 		 1041 aa  719    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  74.15 
 
 		 1024 aa  740    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  72.12 
 
 		 1265 aa  756    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  71.92 
 
 		 1151 aa  744    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  76.79 
 
 		 1194 aa  762    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  74.84 
 
 		 1018 aa  709    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  72.62 
 
 		 1334 aa  767    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 1048 aa  2039    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  67.23 
 
 		 991 aa  680    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  69.34 
 
 		 1040 aa  711    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  67.23 
 
 		 991 aa  680    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  66.47 
 
 		 1016 aa  666    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  72.67 
 
 		 1091 aa  711    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  74.57 
 
 		 1244 aa  667    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  74.05 
 
 		 990 aa  714    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  75.16 
 
 		 1113 aa  745    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  76.52 
 
 		 952 aa  728    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  74.62 
 
 		 702 aa  707    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  69.79 
 
 		 953 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  74.16 
 
 		 1070 aa  708    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  71.96 
 
 		 959 aa  656    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  60.2 
 
 		 1022 aa  593  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  59.27 
 
 		 1093 aa  585  1.0000000000000001e-165  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  50.24 
 
 		 457 aa  399  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  44.79 
 
 		 559 aa  336  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  44.05 
 
 		 564 aa  332  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  44.27 
 
 		 636 aa  320  9e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  41.87 
 
 		 492 aa  319  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  40.93 
 
 		 494 aa  308  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  39.47 
 
 		 543 aa  307  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  41.13 
 
 		 562 aa  304  6.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  41.93 
 
 		 411 aa  302  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  40.19 
 
 		 503 aa  299  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  40.71 
 
 		 496 aa  300  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  41.42 
 
 		 483 aa  299  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  40.8 
 
 		 531 aa  298  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  40.71 
 
 		 496 aa  297  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  38.81 
 
 		 496 aa  296  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  42.54 
 
 		 571 aa  296  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  38.81 
 
 		 496 aa  296  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  41.19 
 
 		 490 aa  293  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  44.28 
 
 		 485 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  44.17 
 
 		 485 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  38.5 
 
 		 503 aa  293  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  40.63 
 
 		 497 aa  291  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  40.29 
 
 		 497 aa  291  6e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  38.04 
 
 		 476 aa  290  9e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  37.59 
 
 		 1076 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  40.53 
 
 		 491 aa  288  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  37.29 
 
 		 1074 aa  287  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  41.25 
 
 		 489 aa  287  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  39.25 
 
 		 499 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  40.05 
 
 		 501 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  38.96 
 
 		 483 aa  286  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  42.72 
 
 		 497 aa  286  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  44 
 
 		 492 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  37.78 
 
 		 530 aa  285  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  41.31 
 
 		 500 aa  283  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  41.01 
 
 		 489 aa  283  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  41.01 
 
 		 489 aa  283  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  39.62 
 
 		 495 aa  282  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  39.62 
 
 		 495 aa  281  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  40.49 
 
 		 489 aa  281  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2436  ribonuclease, Rne/Rng family  37.19 
 
 		 1061 aa  281  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  36.56 
 
 		 926 aa  281  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  44.25 
 
 		 485 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1720  ribonuclease  38.22 
 
 		 1007 aa  280  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  36.98 
 
 		 1132 aa  280  8e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1467  ribonuclease  43.16 
 
 		 1031 aa  280  9e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00760754  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  41.35 
 
 		 483 aa  280  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  42.2 
 
 		 490 aa  280  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  41.81 
 
 		 416 aa  279  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  39.21 
 
 		 1057 aa  279  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  35.81 
 
 		 866 aa  279  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  35.39 
 
 		 1056 aa  278  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4788  ribonuclease  37.5 
 
 		 1038 aa  278  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.870424  normal  0.38307 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  42.64 
 
 		 496 aa  278  3e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  36.56 
 
 		 1012 aa  278  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  37.3 
 
 		 508 aa  278  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  36.74 
 
 		 1132 aa  278  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01517  ribonuclease E  36.5 
 
 		 1238 aa  277  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  43.25 
 
 		 485 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  43.25 
 
 		 485 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  43.25 
 
 		 485 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  40.39 
 
 		 492 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  37.05 
 
 		 528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  35.68 
 
 		 808 aa  276  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2678  ribonuclease, Rne/Rng family  36.98 
 
 		 1091 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.174133 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  40.98 
 
 		 489 aa  276  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>