More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0293 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  100 
 
 		 525 aa  1075    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  50.89 
 
 		 515 aa  528  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  38.21 
 
 		 512 aa  372  1e-102  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  40.67 
 
 		 559 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  40.79 
 
 		 537 aa  352  1e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  39.48 
 
 		 564 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  40.91 
 
 		 503 aa  346  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  37.03 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  37.03 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  37.4 
 
 		 492 aa  343  5.999999999999999e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  37.8 
 
 		 497 aa  342  7e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  40.16 
 
 		 531 aa  342  8e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  40.51 
 
 		 496 aa  342  8e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  40.36 
 
 		 496 aa  342  9e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  37.6 
 
 		 497 aa  341  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  38.49 
 
 		 489 aa  339  8e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  39.06 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  36.76 
 
 		 483 aa  334  3e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  37.66 
 
 		 494 aa  332  8e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  38.22 
 
 		 495 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  36.63 
 
 		 487 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  38 
 
 		 530 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  37.01 
 
 		 495 aa  329  6e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  36.9 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  37.9 
 
 		 497 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  36.05 
 
 		 492 aa  327  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  36.09 
 
 		 483 aa  326  7e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  37.99 
 
 		 492 aa  326  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  37.2 
 
 		 485 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  36.9 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  36.9 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  38.26 
 
 		 808 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  35.84 
 
 		 792 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  36.91 
 
 		 496 aa  323  6e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  36.18 
 
 		 919 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  37.01 
 
 		 485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  37.01 
 
 		 485 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  37.2 
 
 		 485 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  37.01 
 
 		 485 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  37.6 
 
 		 485 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  37.4 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  37.4 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  37.88 
 
 		 926 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  37.4 
 
 		 485 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  37.87 
 
 		 493 aa  317  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  35.25 
 
 		 741 aa  317  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  37.23 
 
 		 489 aa  317  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  39.53 
 
 		 507 aa  316  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  37.03 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  37.03 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  37.03 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  37.03 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  37.03 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  37.03 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  37.03 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  37.62 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  35.91 
 
 		 562 aa  316  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  37.03 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  36.83 
 
 		 489 aa  316  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  36.83 
 
 		 489 aa  316  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  36.83 
 
 		 489 aa  316  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  36.83 
 
 		 489 aa  316  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  36.83 
 
 		 489 aa  316  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1126  ribonuclease G  37.92 
 
 		 491 aa  315  9e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0361848  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  35.67 
 
 		 499 aa  315  9e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  37.01 
 
 		 485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2546  ribonuclease E  38.26 
 
 		 806 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147077  hitchhiker  1.1855699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  37.62 
 
 		 489 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  35.7 
 
 		 485 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  35.64 
 
 		 903 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  36.9 
 
 		 516 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  39.17 
 
 		 500 aa  312  9e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  37.23 
 
 		 489 aa  312  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  39.84 
 
 		 503 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  37.45 
 
 		 517 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  37.65 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  34.97 
 
 		 528 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  34.65 
 
 		 499 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  37.25 
 
 		 866 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  35.11 
 
 		 489 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  36.51 
 
 		 489 aa  309  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  36.51 
 
 		 489 aa  309  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  36.51 
 
 		 489 aa  309  8e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  37.48 
 
 		 488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  36.27 
 
 		 504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  37.21 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  34.03 
 
 		 543 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  37.77 
 
 		 487 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  37.48 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  34.15 
 
 		 636 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  36.11 
 
 		 489 aa  307  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  36.63 
 
 		 489 aa  307  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  35.4 
 
 		 528 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  37.28 
 
 		 502 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  37.28 
 
 		 502 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  35.91 
 
 		 488 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  37.08 
 
 		 502 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  37.09 
 
 		 502 aa  306  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  37.39 
 
 		 514 aa  306  8.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  33.79 
 
 		 501 aa  306  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>