More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1502 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  65.3 
 
 		 1427 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  72.26 
 
 		 974 aa  719    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  66.86 
 
 		 1058 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  57.44 
 
 		 1018 aa  637    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  68.13 
 
 		 1334 aa  706    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  66.08 
 
 		 1265 aa  690    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  69.31 
 
 		 952 aa  682    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  66.8 
 
 		 1043 aa  674    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  68.87 
 
 		 908 aa  665    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  66.21 
 
 		 1016 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  68.09 
 
 		 1117 aa  677    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 1080 aa  2097    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  65.42 
 
 		 987 aa  677    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  68.71 
 
 		 944 aa  666    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  68.09 
 
 		 1024 aa  672    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  61.39 
 
 		 953 aa  645    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  70.29 
 
 		 1194 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  69.59 
 
 		 990 aa  686    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  71.37 
 
 		 1091 aa  697    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  71.69 
 
 		 1093 aa  723    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  65.42 
 
 		 991 aa  677    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  57.22 
 
 		 1040 aa  725    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  69.05 
 
 		 922 aa  681    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  68.56 
 
 		 1113 aa  711    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  62.04 
 
 		 1123 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  68.31 
 
 		 1007 aa  662    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  67.41 
 
 		 702 aa  656    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  70.59 
 
 		 1070 aa  673    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  71.66 
 
 		 1151 aa  712    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  65.42 
 
 		 991 aa  677    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  61.03 
 
 		 961 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  68.3 
 
 		 959 aa  626  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  64.01 
 
 		 717 aa  623  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  66.95 
 
 		 1244 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  64.24 
 
 		 1048 aa  600  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  57.14 
 
 		 1022 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  55.04 
 
 		 1093 aa  570  1e-161  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  50 
 
 		 457 aa  396  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  42.17 
 
 		 559 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  43.58 
 
 		 564 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  41.23 
 
 		 636 aa  310  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  44.09 
 
 		 562 aa  309  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  40.14 
 
 		 494 aa  306  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  42.43 
 
 		 483 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  40.73 
 
 		 492 aa  303  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  40.58 
 
 		 496 aa  302  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  40.58 
 
 		 496 aa  302  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  39.17 
 
 		 476 aa  303  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  41.93 
 
 		 496 aa  299  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  41.93 
 
 		 496 aa  298  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  43.07 
 
 		 571 aa  298  5e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  43.34 
 
 		 416 aa  297  9e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  40.43 
 
 		 503 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  39.74 
 
 		 531 aa  296  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  43.17 
 
 		 492 aa  295  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  38.6 
 
 		 543 aa  295  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  39.37 
 
 		 866 aa  294  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  39.22 
 
 		 926 aa  294  8e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  43.24 
 
 		 485 aa  293  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  40.19 
 
 		 411 aa  293  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  38.44 
 
 		 1076 aa  292  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  43.24 
 
 		 485 aa  293  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  42.44 
 
 		 497 aa  291  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  38.16 
 
 		 741 aa  289  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  42 
 
 		 500 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  37.12 
 
 		 808 aa  288  4e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  36.96 
 
 		 515 aa  288  4e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  40.19 
 
 		 919 aa  287  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  43.46 
 
 		 485 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  42.05 
 
 		 489 aa  287  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  43.46 
 
 		 485 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  42.96 
 
 		 492 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  40.14 
 
 		 503 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  43.46 
 
 		 485 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  44.2 
 
 		 485 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  38.78 
 
 		 1056 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  41.71 
 
 		 491 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  41.91 
 
 		 489 aa  285  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  38.76 
 
 		 1057 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  41.91 
 
 		 489 aa  283  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  40.48 
 
 		 497 aa  283  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  39.85 
 
 		 903 aa  283  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  37.62 
 
 		 1074 aa  283  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  40.49 
 
 		 687 aa  282  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  40.48 
 
 		 497 aa  281  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  40.36 
 
 		 653 aa  282  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  40.36 
 
 		 653 aa  282  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1720  ribonuclease  38.72 
 
 		 1007 aa  281  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  40.79 
 
 		 489 aa  281  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  37.53 
 
 		 1128 aa  281  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  40.49 
 
 		 713 aa  281  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  40.82 
 
 		 495 aa  281  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  38.76 
 
 		 1073 aa  281  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  40.82 
 
 		 495 aa  280  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  37.29 
 
 		 1120 aa  280  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  37.89 
 
 		 938 aa  280  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  37 
 
 		 528 aa  280  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  38.44 
 
 		 1035 aa  280  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  39.25 
 
 		 508 aa  280  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3824  ribonuclease, Rne/Rng family  42.65 
 
 		 484 aa  279  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>